ఉష్ణమండల చేపల వ్యాధులు బ్యాక్టీరియా, ఫంగస్ లేదా పరాన్నజీవుల ద్వారా సంభవించవచ్చు. సాధారణంగా కనిపించే ఉష్ణమండల చేపల వ్యాధులు సెప్టిసిమియా, కాటన్ డిసీజ్, డ్రాప్సీ, ఫిన్ రాట్, ఇచ్, స్విమ్ బ్లాడర్ ఇన్ఫెక్షన్, పాప్ ఐ, తలలో రంధ్రం మొదలైనవి.
ఈ వ్యాధులను కనామైసిన్ సల్ఫేట్, నియోమైసిన్ సల్ఫేట్, పిమాఫిక్స్, మెలాఫిక్స్, కాంట్రాస్ట్, ఫంగిస్టాప్, వాటర్లైఫ్ కుప్రజిన్, వాటర్లైఫ్ మైక్సాజిన్, వాటర్లైఫ్ ప్రోటోజిన్, వాటర్లైఫ్ స్టెరాజిన్ ద్వారా చికిత్స చేయవచ్చు. ట్యాంక్ ఉష్ణోగ్రతను పెంచడం ద్వారా పరాన్నజీవి అంటువ్యాధులు చికిత్స చేయవచ్చు.