జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

R మరియు బయోకండక్టర్ ఉపయోగించి హై త్రూపుట్ జెనోమిక్ డేటా యొక్క విజువలైజేషన్

రుచి యాదవ్ మరియు ప్రాచీ శ్రీవాస్తవ

DNA మైక్రోరేలు, సాంకేతికత అనేక జన్యువులకు ఏకకాలంలో నిర్దిష్ట కణాలు లేదా కణజాలాలలో mRNA స్థాయిలను కొలవడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది. మాలిక్యులర్ బయాలజీలో మైక్రోఅరే ఫలితంగా భారీ డేటాసెట్‌లు కొంత నిర్ధారణకు దారితీసే జీవసంబంధ సమాచారాన్ని సేకరించేందుకు కఠినమైన గణన విశ్లేషణ అవసరం. మైక్రోఅరే చిప్ ప్రింటింగ్ నుండి హైబ్రిడైజేషన్ మరియు స్కానింగ్ ప్రక్రియ వరకు ఇది డేటా నాణ్యతలో వైవిధ్యాన్ని కలిగిస్తుంది, దీని కారణంగా వాస్తవ సమాచారం పోతుంది లేదా అది ప్రాతినిధ్యం వహిస్తుంది. మైక్రోఅరే ఫలితాలలో పొందుపరిచిన జీవసంబంధమైన సమాచారం యొక్క ప్రాసెసింగ్‌కు సంబంధించి మరియు జీవసంబంధమైన వివరణ కోసం వేర్వేరు స్థితిలో వేర్వేరు నమూనాల నుండి పొందిన జన్యు వ్యక్తీకరణ ఫలితాలను పోల్చడానికి గణన విశ్లేషణ ముఖ్యమైన పాత్ర పోషిస్తుంది. మైక్రోఅరే జీన్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ డేటా యొక్క నాణ్యత నియంత్రణ మరియు విజువలైజేషన్ ప్రాథమిక, ఇంకా సవాలుగా ఉండే పని. మైక్రోఅరే విశ్లేషణ కోసం అత్యంత ప్రజాదరణ పొందిన ప్లాట్‌ఫారమ్‌లలో ఒకటి బయోకండక్టర్, ఇది R ప్రోగ్రామింగ్ లాంగ్వేజ్ ఆధారంగా జెనోమిక్ డేటా యొక్క విశ్లేషణ మరియు గ్రహణశక్తి కోసం ఓపెన్ సోర్స్ మరియు ఓపెన్ డెవలప్‌మెంట్ సాఫ్ట్‌వేర్ ప్రాజెక్ట్. ఈ కాగితం GEO డేటాబేస్ GSE53890 నుండి డేటాను ఉపయోగించి Affymetrix జీన్ చిప్ యొక్క నాణ్యత అంచనాను నిర్వహించడానికి నిర్దిష్ట విధానాలను వివరిస్తుంది మరియు వివరణాత్మక విశ్లేషణ కోసం విజువలైజేషన్ ప్లాట్‌ల సూచనతో బయోకండక్టర్ యొక్క నాణ్యత నియంత్రణ ప్యాకేజీలను వివరిస్తుంది. శాస్త్రీయ వివరణలతో పాటు అఫిమెట్రిక్స్ చిప్ యొక్క నాణ్యత నియంత్రణ విశ్లేషణ కోసం మైక్రోఅరే విశ్లేషణపై పని చేసే ఏ పరిశోధకుడైనా ఈ పేపర్ సహాయకరంగా ఉంటుంది.