జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

కలర్‌మెట్రిక్ లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ ద్వారా కర్లీ టాప్ వైరస్ యొక్క విజువల్ డిటెక్షన్

మహ్మద్ అమీన్ అల్మాసి, మెహదీ అఘపూర్-ఓజఘ్‌కండి మరియు సయీదే అఘై

షుగర్ బీట్‌లోని కర్లీ టాప్ వైరస్ (CTV), జెమినివిరిడే కుటుంబానికి చెందిన మేధావి కర్టోవైరస్ ఇరాన్ మరియు ప్రపంచంలోని ఇతర సెమీరిడ్ ప్రాంతాలలో గణనీయమైన సమస్య. CTVని గుర్తించడానికి అనేక రోగనిర్ధారణ పద్ధతులు ఉన్నాయి, కానీ ఈ పద్ధతులు 3 గంటల వరకు చాలా సమయం తీసుకుంటాయి, దీనికి అధునాతన సాధనాలు అవసరం. ఈ అధ్యయనం యొక్క లక్ష్యం, మొదటిసారిగా, చక్కెర దుంపలో CTVని గుర్తించడానికి అవసరమైన సమయాన్ని తగ్గించడం, కలర్‌మెట్రిక్ లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ (LAMP) టెక్నిక్‌ని ఉపయోగించి సాధారణ నీటి స్నానం లేదా థర్మోబ్లాక్ మాత్రమే అవసరం.DNA సహజంగా సోకిన వాటి నుండి సేకరించబడింది. ఆకు కణజాలం. జాతుల ప్రైమర్‌లను ఉపయోగించి రెప్లికేషన్-అనుబంధ ప్రోటీన్ (ప్రతినిధి) జన్యువును విస్తరించడానికి PCR మరియు LAMP ప్రతిచర్యల ద్వారా కర్టోవైరస్ జాతుల ఉనికి కోసం నమూనాలను పరీక్షించారు. 30 నిమిషాల పాటు 63°C వద్ద పొదిగేటటువంటి ఐసోథర్మల్ పరిస్థితులలో CTV DNAని విస్తరించేందుకు LAMP ఆప్టిమైజ్ చేయబడింది. వివిధ రంగులను ఉపయోగించి LAMP ఉత్పత్తులు దృశ్యమానంగా కనుగొనబడ్డాయి. LAMP యాంప్లిఫికేషన్ ఉత్పత్తులు ఒక అగరోజ్ జెల్‌పై ఎలెక్ట్రోఫోరైజ్ చేసినప్పుడు నిచ్చెన-వంటి రూపాన్ని కలిగి ఉంటాయి మరియు విభిన్న రంగులను ఉపయోగించి సానుకూల ఫలితాలు రంగులో మారాయి. వివిధ రంగులతో LAMP నిర్ధారించబడిన ఫలితాలు చక్కెర దుంపలో CTVని గుర్తించడానికి వేగవంతమైన మరియు సురక్షితమైన పరీక్షను అందిస్తాయి. ఇతర పరమాణు పద్ధతులతో, థర్మోసైక్లర్ లేదా ఖరీదైన డిటెక్టర్ సిస్టమ్‌లతో ప్రయోగశాలలను సన్నద్ధం చేయడం అనివార్యం కాబట్టి, ఈ పరీక్ష ఒక సరళమైన, ఖర్చుతో కూడుకున్న పరమాణు పద్ధతిగా గుర్తించబడింది, ఇది ఖరీదైన పరికరాలు అవసరం లేకుండా ప్రాథమిక ప్రయోగశాలలలో ఇతర రోగనిర్ధారణలను భర్తీ చేయగల సామర్థ్యాన్ని కలిగి ఉంటుంది. ప్రత్యేక పద్ధతులు. తదుపరి పరిశోధనలలో ఇది నమ్మదగిన ప్రత్యామ్నాయ వైరల్ డిటెక్షన్ సిస్టమ్‌గా కూడా పరిగణించబడుతుంది.