జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

ఇథియోపియా, తూర్పు మరియు మధ్య ఆఫ్రికాలో కాఫీ విల్ట్ వ్యాధికి కారణమయ్యే ఫ్యూసేరియం జిలారోయిడ్స్‌ను ప్రత్యేకంగా గుర్తించడానికి మరియు నిర్ధారించడానికి అనువాద పొడిగింపు కారకం జన్యువును ఉపయోగించడం .

ఒలాల్ ఎస్, ఒలాంగో ఎన్, కిగ్గుండు ఎ, ఓచ్వో ఎస్, అడ్రికో జె, నాంటెజా ఎ, మాటోవు ఇ, లుబెగా జిడబ్ల్యూ, కగేజీ జి, హకీజా జిజె, వాగోయిర్ డబ్ల్యూడబ్ల్యూ, రూథర్‌ఫోర్డ్ ఎంఏ మరియు ఓపియో SO

ప్రస్తుత అధ్యయనం F usarium xylarioides (అనామోర్ఫ్: G ibberrela xylarioides) యొక్క నిర్దిష్ట గుర్తింపు మరియు నిర్ధారణ కోసం DNA-ఆధారిత పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (PCR) యొక్క అప్లికేషన్‌పై మొదటి నివేదికను అందజేస్తుంది. Fusarium xylarioides కాఫీ విల్ట్ వ్యాధి (ట్రాకియోమైకోసిస్) యొక్క కారక ఏజెంట్, మరియు ఉగాండాలో రోబస్టా కాఫీ ఉత్పత్తిలో ఈ వ్యాధి అత్యంత ముఖ్యమైన ఆర్థిక అవరోధం. వ్యాధికారకానికి రెండు జాతులు ఉన్నాయి, ఒకటి రోబస్టా కాఫీకి మరియు మరొకటి అరబికా కాఫీకి వ్యాధికారకమైనది మరియు దీనికి విరుద్ధంగా కాదు. దీని ప్రయోగశాల రోగనిర్ధారణ ప్రధానంగా సూక్ష్మదర్శినిపై ఆధారపడింది, ఇది నెమ్మదిగా ఉంటుంది, పేలవమైన వివక్షత కలిగి ఉంటుంది, అధిక నైపుణ్యం అవసరం, లక్షణాలు ఉన్న అతిధేయ మొక్కలపై మాత్రమే వర్తిస్తుంది మరియు మట్టి నుండి వ్యాధికారకాన్ని గుర్తించడంలో విఫలమైంది. అనువాద పొడుగు కారకం-1α (TEF-1α) సోకిన రోబస్టా కాఫీ ప్లాంట్ నుండి వేరుచేయబడిన ఒక F. జిలారియోయిడ్స్ జన్యువు ఫ్యూసేరియం జాతి నిర్దిష్ట ప్రైమర్ ద్వారా విస్తరించబడింది, ఆపై PCR ఉత్పత్తి క్రమం చేయబడింది. నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌ను రూపొందించడానికి సీక్వెన్స్ డేటా ఉపయోగించబడింది. ప్రైమర్-బ్లాస్ట్ ఉత్పత్తి కేవలం F. xylarioides సీక్వెన్స్‌లతో మాత్రమే సరిపోలుతుందని కనుగొనబడింది, ఇందులో 75% రోబస్టా మరియు 25% అరేబికా కాఫీకి వ్యాధికారక జాతులు ఉన్నాయి. PCR ద్వారా విట్రో పరీక్షలో 284bp ఉత్పత్తిని విస్తరించే F. xylarioidesకి మాత్రమే ప్రైమర్ నిర్దిష్టంగా ఉన్నట్లు చూపించింది మరియు F. xylarioides అన్ని దగ్గరి సంబంధిత జాతుల Fusarium మరియు పరీక్షించబడిన ఇతర మొక్కల వ్యాధికారకాలను వేరు చేయగలిగింది. ఇంకా ఇది ఉగాండాలోని వివిధ ప్రాంతాల నుండి అన్ని F. xylarioides ఐసోలేట్‌ల నుండి DNAని విస్తరించగలిగింది మరియు DNA సాంద్రతలను నిమిషంలో 0.78 ng/µLగా విస్తరించింది.