ఓర్లీ డైమ్
ఇన్హిబిటర్లతో కూడిన అపో ప్రోటీన్లు మరియు ప్రొటీన్ల యొక్క 3D నిర్మాణం స్ట్రక్చర్-బేస్డ్ డ్రగ్ డిజైన్ అధ్యయనాలకు ఆధారాన్ని అందిస్తుంది మరియు మరింత శక్తివంతమైన ఔషధం కోసం శోధించడానికి డాకింగ్ విధానాలలో కూడా ఉపయోగించబడుతుంది. ఎక్స్-రే క్రిస్టల్లాగ్రఫీని ఉపయోగించి ఎసిటైల్ కోలినెస్టరేస్ (ACHE) మరియు ఫాస్ఫోట్రీస్టేరేస్ (PTE) యొక్క ఔషధ రూపకల్పనకు నిర్దిష్ట ఉదాహరణలు అందించబడతాయి. కంప్యూటేషనల్ డాకింగ్ డ్రగ్ డిజైన్ విధానం మరియు ACHE క్రిస్టల్ స్ట్రక్చర్ల మధ్య తులనాత్మక విశ్లేషణ ఎంజైమ్ యొక్క యాక్టివ్-సైట్ జార్జ్లోని లిగాండ్ల స్థానం స్ఫటికీకరణ పరిస్థితుల ద్వారా ప్రభావితమవుతుందని తిట్టిపోసింది. స్పెక్ట్రోస్కోపిక్ సాక్ష్యం మరియు థర్మల్ స్టెబిలిటీ ఫలితాలు లిగాండ్ పొజిషనింగ్లో అటువంటి వ్యత్యాసానికి మద్దతు ఇచ్చాయి. ఈ ఫలితాలు డాకింగ్ విధానాలను ఉపయోగించి నిర్మాణ-ఆధారిత ఔషధ రూపకల్పనకు చిక్కులను కలిగి ఉంటాయి. మేము అపో యొక్క పంతొమ్మిది క్రిస్టల్ నిర్మాణాలను మరియు కొన్ని అత్యంత అభివృద్ధి చెందిన PTE వేరియంట్లకు కట్టుబడి ఉన్న అనేక ఫాస్ఫోనేట్ (OP) అనలాగ్లను కూడా విశ్లేషించాము. విభిన్న PTE వేరియంట్ల క్రియాశీల సైట్లోకి OPల బైండింగ్ మోడ్లపై అంతర్దృష్టులను అందించడంతో పాటు, డేటా ప్రోటీన్ వ్యక్తీకరణకు ఉపయోగించే ట్యాగ్ల ప్రాముఖ్యత, 'సముచితమైన' స్ఫటికీకరణ పరిస్థితులు, ప్రోటీన్ నిర్మాణాలు మరియు అంతరిక్ష సమూహాలను వెల్లడిస్తుంది. మరియు నిర్మాణ-ఆధారిత ఔషధ రూపకల్పనకు వాటి చిక్కులు.