జర్నల్ ఆఫ్ ఫార్మకోజెనోమిక్స్ & ఫార్మాకోప్రొటోమిక్స్

నైరూప్య

మెథనోపైరస్ కండ్లేరి AV19 యొక్క పూర్తి జీనోమ్‌లో సెలెనోసిస్టీన్ tRNA యొక్క అణచివేత వైవిధ్యాలు

ఉత్తమ్ రాయ్మండల్, శిబ్ శంకర్ దాస్, రియా రక్షిత్ మరియు సత్యబ్రత సాహూ4*

ఆర్కియాలో, మునుపటి అధ్యయనాలు బహుళ ఇంట్రాన్-కలిగిన tRNAలు మరియు స్ప్లిట్ tRNAల ఉనికిని వెల్లడించాయి. ఆర్కియాలో వివిధ రకాల అంతరాయం కలిగించిన tRNA జన్యువులు ఉన్నందున, ఆర్కియల్ tRNA జన్యువుల యొక్క పూర్తి నిర్విషీకరణ విశ్లేషణ బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ రంగంలో ఒక సవాలుతో కూడుకున్న పనిగా మిగిలిపోయింది. తప్పిపోయిన tRNAల యొక్క అణచివేత వేరియంట్‌లను రూపొందించడానికి tRNA అర్ధభాగాలను ఎన్‌కోడింగ్ చేసే విస్తృతంగా వేరు చేయబడిన జన్యువుల కోసం శోధించే గణన పద్ధతిని ఇక్కడ మేము సూచించాము. జన్యువు అంతటా విస్తృతంగా వేరు చేయబడిన స్ప్లిట్ tRNA జన్యువుల ఉనికిని పరిగణనలోకి తీసుకుంటే, స్ప్లిట్ పరికల్పనతో ఒప్పందంలో tRNA యొక్క సంరక్షించబడిన టెర్మినల్ 5'- మరియు 3'-మోటిఫ్ రెండింటినీ శోధించడం ద్వారా అటువంటి వేరు చేయబడిన tRNA జన్యువులను అంచనా వేయడానికి మేము మా tRNA శోధన అల్గారిథమ్‌ను అభివృద్ధి చేసాము. క్లోవర్‌లీఫ్ ప్రిడిక్షన్ మరియు ఉబ్బెత్తు-హెలిక్స్-బల్జ్ యొక్క సిలికో నిర్ధారణలో ఖచ్చితమైనది స్ప్లైస్ సైట్‌లలో ద్వితీయ నిర్మాణం. తప్పిపోయిన tRNA జన్యువుల కోసం సమగ్ర శోధన ద్వారా, మేము మెథనోపైరస్ కండ్లేరి AV19 లో చొప్పించిన సెలెనోసిస్టీన్ tRNA యొక్క కొత్త వైవిధ్యాలను వర్గీకరించాము . M. కండ్లేరి AV19 యొక్క పూర్తి జీనోమ్ సీక్వెన్స్ యొక్క విశ్లేషణ సెలెనోసిస్టీన్ (సెకన్) చదవడానికి నాన్-కోడింగ్ RNA డీకోడింగ్ UGA యొక్క ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ యొక్క బహుళ మోడ్‌ను వెల్లడించింది మరియు అంతరాయం కలిగించిన tRNA జన్యువులు 002E గురించి మరింత అధ్యయనం చేయాలని సూచించింది.