టియా హుస్సో, మిక్కో పి. టురునెన్ మరియు సెప్పో య్లా-హెర్టువాలా
క్యాన్సర్ మరియు హృదయ సంబంధ వ్యాధుల వంటి అనేక వ్యాధులలో వాస్కులర్ ఎండోథెలియల్ గ్రోత్ ఫ్యాక్టర్ (VEGF-A) ఒక ముఖ్యమైన జన్యువు. ప్రమోటర్ టార్గెటెడ్ స్మాల్ హెయిర్పిన్ RNAలను (shRNAలు) ఉపయోగించి VEGF-A యొక్క వ్యక్తీకరణ బాహ్యజన్యుపరంగా మాడ్యులేట్ చేయబడినప్పుడు మురిన్ ఎండోథెలియల్ కణాలలో జన్యు-వ్యాప్త జన్యు వ్యక్తీకరణ నమూనాలలో మార్పులను మేము పరిశోధించాము. మురిన్ ఎండోథెలియల్ కణాలు జన్యు ప్రమోటర్కు అనుబంధంగా ఉండే shRNAలను వ్యక్తీకరించే లెంటివైరల్ వెక్టర్లతో ప్రసారం చేయబడ్డాయి. VEGF-Aని పెంచడం మరియు తగ్గించడం వల్ల జన్యు-వ్యాప్తంగా ఉన్న mRNA వ్యక్తీకరణ మార్పులను పరిశోధించడానికి జన్యు వ్యక్తీకరణ శ్రేణి ప్రయోగాలు నిర్వహించబడ్డాయి. అనువర్తిత గణాంక ప్రమాణాల ప్రకారం అనేక వందల విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు ఉన్నాయి. VEGF-A నియంత్రణ ప్రభావాల కంటే VEGF-Aని తగ్గించడం వల్ల కలిగే ప్రభావాలు చాలా విస్తృతంగా ఉన్నాయని మేము గమనించాము. VEGF-A వ్యక్తీకరణపై బాహ్యజన్యు ప్రభావాల కారణంగా అనేక విభిన్న జీవ ప్రక్రియలు మార్చబడుతున్నాయని మా ఇన్ సిలికో విశ్లేషణ వెల్లడించింది. VEGF-A మధ్యవర్తిత్వ ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ ప్రతిస్పందన యొక్క ప్రధాన నియంత్రకాలలో ఒకటి ట్రాన్స్క్రిప్షన్ కారకం ATF-4గా కనుగొనబడింది. ఎండోథెలియల్ కణాలలో VEGF-A వ్యక్తీకరణ యొక్క బాహ్యజన్యు మార్పుకు ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ ప్రతిస్పందనను చూపించే మొదటి అధ్యయనం ఇది. బాహ్యజన్యు జన్యు నియంత్రణ అనేది సహజ జన్యు నియంత్రణ యంత్రాంగాన్ని సూచిస్తుంది మరియు ఈ ఫలితాలు ఎండోథెలియల్ కణాలలో VEGF-A నియంత్రణ యొక్క గతంలో తెలియని చిక్కులను వెల్లడిస్తాయి.