జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

డిటర్మినిస్టిక్ సీక్వెన్షియల్ శాంప్లింగ్ ఉపయోగించి ప్రోటీన్ సెకండరీ స్ట్రక్చర్ ప్రిడిక్షన్

కువో-చింగ్ లియాంగ్ మరియు జియాడోంగ్ వాంగ్

ప్రోటీన్ యొక్క ద్వితీయ నిర్మాణాన్ని దాని అమైనో ఆమ్ల శ్రేణి నుండి అంచనా వేయడం దాని త్రిమితీయ నిర్మాణం యొక్క అంచనా వైపు ఒక ముఖ్యమైన దశ. ఇప్పటికే ఉన్న అనేక అల్గారిథమ్‌లు ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్‌లో తెలిసిన ద్వితీయ నిర్మాణాలతో ప్రోటీన్‌లకు సారూప్యత మరియు హోమోలజీని ఉపయోగించుకుంటున్నప్పటికీ, తక్కువ సారూప్యత కలిగిన ఇతర ప్రోటీన్‌లకు వాటి ద్వితీయ నిర్మాణాన్ని కనుగొనడానికి ఒకే శ్రేణి విధానం అవసరం. ఈ కాగితంలో మేము సింగిల్-సీక్వెన్స్ ప్రోటీన్ సెకండరీ స్ట్రక్చర్ ప్రిడిక్షన్ కోసం నిర్ణయాత్మక సీక్వెన్షియల్ శాంప్లింగ్ పద్ధతి మరియు దాచిన మార్కోవ్ మోడల్ ఆధారంగా ఒక అల్గోరిథంను ప్రతిపాదిస్తాము. అంచనాలు విండోడ్ అబ్జర్వేషన్‌ల ఆధారంగా మరియు అబ్జర్వేషన్ విండోలో సాధ్యమయ్యే కన్ఫర్మేషన్‌ల కంటే వెయిటెడ్ సగటు ఆధారంగా రూపొందించబడ్డాయి. ప్రస్తుత సింగిల్-సీక్వెన్స్ అల్గారిథమ్‌తో పోలిస్తే వాస్తవ డేటాసెట్‌లో మెరుగైన పనితీరును సాధించడానికి ప్రతిపాదిత అల్గోరిథం చూపబడింది.