జర్నల్ ఆఫ్ కార్సినోజెనిసిస్ & మ్యూటాజెనిసిస్

నైరూప్య

హెపాటోసెల్యులార్ మరియు సంబంధిత ADAR1-Hi క్యాన్సర్‌లలో ఉత్పరివర్తన జెనోమిక్ డ్రైవర్‌గా WA-సైట్‌లలో ADAR1 A-to-I డీమినేషన్‌కు ఊహాత్మక సాక్ష్యం

రాబిన్ A. లిండ్లీ, ఎడ్వర్డ్ J. స్టీల్

హెపాటోసెల్లర్ క్యాన్సర్ (HCC)లో RNA ఎడిటింగ్ ఎంజైమ్ ADAR1 యొక్క ఓవర్ ఎక్స్‌ప్రెషన్ ఉంది. ఇంకా, HCCలోని ప్రముఖ జెనోమిక్ సోమాటిక్ మ్యుటేషన్ సంతకం దాదాపుగా A:T బేస్ జతలలో ఉత్పరివర్తనాలపై దృష్టి సారిస్తుంది, ఇక్కడ A-to-G ఉత్పరివర్తనలు T-to-C ఉత్పరివర్తనాలను మించి ఉంటాయి (ట్రాన్స్‌క్రిప్ట్ చేయని స్ట్రాండ్‌పై చదివినప్పుడు). ఈ ఎక్స్‌ట్రీమ్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ స్ట్రాండ్ బయాస్డ్ మ్యుటేషన్ సిగ్నేచర్ కోసం స్పష్టమైన మెకానిజం, ADAR1 డీమినేస్ యొక్క ఓవర్ ఎక్స్‌ప్రెషన్‌తో ముడిపడి ఉంది, ఇంకా స్పష్టంగా ప్రదర్శించబడలేదు. ఈ స్ట్రాండ్ బయాస్ యొక్క ప్రామాణిక వివరణ నామమాత్రంగా "ట్రాన్స్క్రిప్షన్ కపుల్డ్ డ్యామేజ్" (TCD) అని పిలువబడింది, దీనిని మరింత సాంప్రదాయ "ట్రాన్స్క్రిప్షన్ కపుల్డ్ రిపేర్" (TCR) నుండి వేరు చేస్తుంది. TCD వివరణ పరమాణు సాక్ష్యం యొక్క అన్ని లక్షణాలను సంతృప్తి పరచలేదని మేము చూపిస్తాము. సాంప్రదాయ దృక్పథం ఏమిటంటే, ADAR1 ట్రాన్‌స్క్రిప్ట్‌లలో డబుల్ స్ట్రాండెడ్ RNA స్టెమ్-లూప్ స్ట్రక్చర్‌లలో ఇనోసిన్ (I)కి సవరించడం కోసం WA-సైట్‌లలో అడెనోసిన్‌లను లక్ష్యంగా చేసుకుంటుందని భావిస్తున్నారు. ఈ మ్యుటేషన్ సంతకాలపై పరమాణు మరియు సెల్యులార్ డేటా యొక్క సంపూర్ణత హెపాటోసెల్యులార్ మరియు బహుశా ఇతర సంబంధిత ADAR1-లో ఉత్పరివర్తన డ్రైవర్‌గా WA-సైట్‌లలో ADAR1-మధ్యవర్తిత్వ A-to-I డీమినేషన్‌కు స్పష్టమైన పాత్ర కోసం బలమైన ఊహాజనిత సాక్ష్యాలను అందిస్తుంది. హాయ్ క్యాన్సర్‌లు A:T బేస్ జతల వద్ద పక్షపాత మ్యుటేషన్ లక్షణాలను ప్రదర్శిస్తున్నాయి.