జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

PICRUSt2 మరియు పిఫిలిన్ పైప్‌లైన్‌లను ఉపయోగించి భారతదేశంలోని సహజంగా పులియబెట్టిన పాల ఉత్పత్తులలో బాక్టీరియా యొక్క ప్రిడిక్టివ్ ఫంక్షనాలిటీ

H. నకిబాఫెర్ జోన్స్ షాంగ్ప్లియాంగ్, జ్యోతి ప్రకాష్ తమంగ్*

సహజంగా పులియబెట్టిన పాలు (NFM) ఉత్పత్తులు భారతదేశంలోని సిక్కిం మరియు అరుణాచల్ ప్రదేశ్‌లలో ప్రసిద్ధ ఆహార వంటకాలు. భారతదేశంలోని ఈ NFM ఉత్పత్తులలోని బాక్టీరియల్ కమ్యూనిటీలు గతంలో హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్స్ పద్ధతి ద్వారా విశ్లేషించబడ్డాయి. అయినప్పటికీ, భారతదేశంలోని NFM ఉత్పత్తుల యొక్క ప్రిడిక్టివ్ జీన్ కార్యాచరణ అధ్యయనం చేయబడలేదు. ఈ అధ్యయనంలో, సిక్కిం మరియు అరుణాచల్ ప్రదేశ్ యొక్క NFM ఉత్పత్తుల యొక్క ముడి క్రమాలు MG-RAST/NCBI డేటాబేస్ సర్వర్ నుండి యాక్సెస్ చేయబడ్డాయి. సూక్ష్మజీవుల ఫంక్షనల్ జన్యు అంచనాను అధ్యయనం చేయడానికి PICRUSt2 మరియు పిఫిలిన్ సాధనాలు వర్తింపజేయబడ్డాయి. MUSiCC- సాధారణీకరించిన KOలు మరియు PICRUSt2 మరియు Piphillin రెండింటి నుండి KEGG మార్గాలను మ్యాప్ చేయడం వలన రెండో వాటితో పోల్చితే మునుపటి వాటి శాతం ఎక్కువ. అయితే, ఫంక్షనల్ ఫీచర్లు రెండు పైప్‌లైన్‌ల నుండి పోల్చబడ్డాయి, అయితే, అంచనాల మధ్య గణనీయమైన తేడాలు ఉన్నాయి. అందువల్ల, రెండు అల్గారిథమ్‌ల యొక్క ఏకీకృత ప్రదర్శన భారతదేశంలోని NFM ఉత్పత్తుల యొక్క మైక్రోబయోటాతో అనుబంధించబడిన ప్రిడిక్టివ్ ఫంక్షనల్ ప్రొఫైల్‌లకు మొత్తం దృక్పథాన్ని అందించింది.