జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

H5N1 మరియు H1N1 NS1 ప్రొటీన్‌లకు వ్యతిరేకంగా మైక్రో RNAల అంచనా: నిర్దిష్ట చికిత్సా అభివృద్ధికి ఒక విండో క్రమం

పంకజ్ కోపర్డే మరియు శైలజా సింగ్

ప్రేరణ: ఇన్‌ఫ్లుఎంజా యాంటీజెనిక్ ప్రొటీన్‌ల యొక్క అత్యంత వేరియబుల్ స్వభావం కారణంగా సంప్రదాయ ఇన్‌ఫ్లుఎంజా మందులు చర్యలో వైఫల్యానికి దారి తీయవచ్చు. సీక్వెన్స్ స్పెసిఫిక్ థెరప్యూటిక్స్ యొక్క సిలికో ప్రిడిక్షన్‌లో తక్కువ సమయం తీసుకుంటుంది మరియు ఖర్చుతో కూడుకున్నది. చాలా వరకు miRNA టార్గెట్ ప్రిడిక్షన్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లు వాటి నిర్దిష్టత మరియు అంచనాలో సున్నితత్వంలో విభిన్నంగా ఉంటాయి. ఏవియన్ ఇన్ఫ్లుఎంజా H5N1 వైరస్ యొక్క నాన్-స్ట్రక్చరల్ ప్రోటీన్ 1 మరియు సెగ్మెంట్ 8 స్వైన్ ఇన్ఫ్లుఎంజా H1N1 వైరస్‌కు వ్యతిరేకంగా మైక్రో RNAలను అంచనా వేయడానికి ఇక్కడ మేము బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విధానాన్ని ప్రతిపాదిస్తున్నాము.

ఫలితాలు: hsa-miR-138, hsa-miR-525-5p మరియు hsa-miR-124 H5N1 వైరస్ యొక్క NS1 ప్రోటీన్‌కు వ్యతిరేకంగా సంభావ్య శ్రేణి నిర్దిష్ట చికిత్సా ఏజెంట్‌లుగా క్రమబద్ధీకరించబడ్డాయి. వివిధ H1N1 సెగ్మెంట్ 8 జన్యువులపై ఇలాంటి అధ్యయనాలు miRNAల అంచనాకు దారితీశాయి, వీటిని యాంటీ ఇన్ఫ్లుఎంజా ఏజెంట్లుగా ఉపయోగించవచ్చు. అంచనా వేయబడిన మైక్రో RNAలు హోస్ట్ సెల్ యొక్క నియంత్రణ ప్రక్రియలలో పాత్రలను కలిగి ఉంటాయి, MAPK పాత్‌వే, mTOR మార్గంతో సహా ఒత్తిడి సంబంధిత మార్గాలు మరియు క్యాన్సర్‌కు సంబంధించిన మార్గాలలో పాలుపంచుకున్నట్లు కనుగొనబడింది.