జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

పాలిమరేస్ మరియు కోట్ ప్రొటీన్ జెన్‌లు గోధుమ పసుపు మరగుజ్జు వైరస్‌లో లక్ష్యంగా మరియు వర్ణించబడ్డాయి, అమినో యాసిడ్‌లను జెన్‌బ్యాంక్‌లోని గ్రూప్ సభ్యులతో పోల్చారు.

హోడా వజిరి*

ఈజిప్టులో పెరిగిన గోధుమ మొక్కలు వైరస్ వంటి లక్షణాలను చూపుతాయి గోధుమ పసుపు మరగుజ్జు RT-PCR పద్ధతిని ఉపయోగించి వర్గీకరించబడింది. ఓపెన్ రీడింగ్ ఫ్రేమ్ (ORF1)లో ఉన్న పాలిమరేస్ జన్యువు (P1) కోసం గోధుమ పసుపు మరగుజ్జు వైరస్ (WYDV- PAV) వేరుచేయబడిన రెండు కోడింగ్ ప్రాంతాలు మరియు ఓపెన్ రీడింగ్ ఫ్రేమ్ (ORF3)లో ఉన్న కోట్ ప్రోటీన్ జన్యువు లక్ష్యంగా చేయబడ్డాయి.
జెన్‌బ్యాంక్‌లోని BYDV-PAV ఐసోలేట్ ప్రకారం నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌ల యొక్క రెండు సెట్‌లు రూపొందించబడ్డాయి. BYDV-PAV యొక్క ఈజిప్షియన్ ఐసోలేట్ యొక్క ORF1 మరియు ORF3 యొక్క DNA శకలాలు క్లోన్ చేయబడ్డాయి మరియు క్రమం చేయబడ్డాయి. ఈ క్రమంలో వైరల్ పాలిమరేస్ జన్యువు కోసం పూర్తిస్థాయి ORF1 కోడింగ్ ఉంది. ఇది 910 nt పొడవును కలిగి ఉంటుంది, ఇది 34.67 M(r)తో 303 అమైనో ఆమ్లాల అంచనా పాలీపెప్టైడ్ గొలుసును ఎన్కోడ్ చేస్తుంది. మరోవైపు, వైరల్ కోట్ ప్రోటీన్ కోసం ORF3 కోడింగ్ కోసం సీక్వెన్స్ డేటా 603 bp పొడవు ఉందని వెల్లడించింది, ఇది 21.96 KDa పరమాణు బరువుతో అంచనా వేయబడిన ప్రోటీన్ 200 అమైనో ఆమ్లాలను ఎన్కోడ్ చేస్తుంది. అయినప్పటికీ, NCBI జెన్‌బ్యాంక్‌లో అందుబాటులో ఉన్న ఐసోలేట్‌లతో ఈజిప్షియన్ ఐసోలేట్ Egy-Wz యొక్క బహుళ శ్రేణి అమరికలపై ఆధారపడిన ఫైలోజెనెటిక్ హోమోలజీ ట్రీ, పాలిమరేస్ జన్యువు 76.5%-99% మరియు 71.6%-93.2% సీక్వెన్స్ ఐడెంటిటీలను అమైనోటైడ్ ఆమ్లం మరియు న్యూక్లియోటైడ్ వద్ద పంచుకున్నట్లు వెల్లడించింది. 05GG2, PAV 014తో స్థాయిలు మరియు PAV014, PAV-Aus వరుసగా వేరుచేస్తుంది. మరోవైపు, కోట్ ప్రోటీన్ జన్యువు అమైనో ఆమ్లం మరియు న్యూక్లియోటైడ్ స్థాయిలో వరుసగా 06KM14 మరియు 05GG2 అనే రెండు ఐసోలేట్‌లతో 85.1% -99.5% మరియు 89.7% -99.2% శ్రేణి సారూప్యతను చూపించింది.