జీవశాస్త్రం మరియు వైద్యం

నైరూప్య

యుబిక్విటిన్ కంజుగేటింగ్ (E2) ఎంజైమ్‌ల ఫైలోజెని పునర్నిర్మాణం

ముహమ్మద్ ఖాన్, కైసర్ జమీల్

ఫైలోజెని పునర్నిర్మాణం గత కొన్ని సంవత్సరాలుగా జన్యు-ఆర్డర్ డేటా నుండి జీవశాస్త్రవేత్తలు మరియు కంప్యూటర్ శాస్త్రవేత్తల నుండి చాలా దృష్టిని ఆకర్షించింది. యుబిక్విటిన్ యూకారియోట్‌లలో విస్తృతంగా వ్యాపించింది మరియు కణాలలో ఎంపిక చేసిన ATP ఆధారిత ప్రోటీన్ క్షీణతలో కీలక పాత్ర పోషిస్తుంది. ఇది అనేక రకాల క్యాన్సర్లలో కూడా ఎక్కువగా వ్యక్తీకరించబడింది. అందువల్ల, యూకారియాలో దాని వైవిధ్యతను అర్థం చేసుకోవడానికి మేము వివిధ గణన పద్ధతులను ఉపయోగించి దాని ఫైలోజెనిని గుర్తించడానికి ఈ అధ్యయనాన్ని చేపట్టాము. యుబిక్విటిన్ కంజుగేటింగ్ ఎంజైమ్ యొక్క అన్ని సీక్వెన్సులు ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్ (PDB) నుండి సంగ్రహించబడ్డాయి మరియు PHYMLలో అమలు చేయబడిన విధంగా గరిష్ట లైక్‌లిహుడ్ పద్ధతిని ఉపయోగించి మరియు అన్‌రూట్ చేయని ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు నిర్మించబడింది. ఈ చెట్టుకు నాలుగు ప్రధాన సమూహాలు మరియు ఒక మినీ క్లస్టర్ ఉన్నాయి. ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ ఎవల్యూషన్‌లో ఫంక్షనల్ ప్రాముఖ్యత యొక్క సైట్-నిర్దిష్ట మార్పు నుండి జన్యువు యొక్క సమూహాల కోసం మేము భిన్నత్వాన్ని లెక్కించాము. RASMOL ఉపయోగించి PDB డేటా బ్యాంక్: (IL7K) నుండి పొందిన ube2c ప్రోటీన్ యొక్క 3-D నిర్మాణంపై డైవర్జెన్స్ మ్యాప్ చేయబడింది. ఈ అధ్యయనం నుండి, E2ల క్రియాశీల పరిణామం జరుగుతున్న ఖచ్చితమైన సైట్‌లను మేము ఎత్తి చూపగలిగాము మరియు ఈ సైట్‌లు బలమైన శుద్ధి ఎంపికకు లోబడి ఉన్నాయని స్పష్టంగా తెలుస్తుంది. ఈ ప్రోటీన్‌లోని ఉత్పరివర్తనలు కణితి పురోగతిని ప్రోత్సహించే అవకాశం ఉందని నివేదికలు ఉన్నందున ఈ సమాచారం నియోప్లాసియాలో కొన్ని ఉపయోగకరమైన చిక్కులను కలిగి ఉంటుందని మేము అంచనా వేస్తున్నాము.