ఫరీహా అల్తాఫ్*, అబ్బాస్ ముహమ్మద్
స్ట్రెప్టోకోకస్ న్యుమోనియా ( S. న్యుమోనియా ) అనేది మానవ వ్యాధికారక మరియు ప్రపంచవ్యాప్తంగా మరణాలు మరియు అనారోగ్యాలకు ప్రధాన కారణం. స్ట్రెప్టోకోకస్ న్యుమోనియా అనేది ఓటిటిస్ మీడియా, న్యుమోనియా, మెనింజైటిస్ మరియు బాక్టీరిమియాకు కారణమయ్యే ఏజెంట్. పిల్లలు, వృద్ధులు మరియు రాజీపడిన రోగనిరోధక వ్యవస్థ కలిగిన రోగులు ఈ బ్యాక్టీరియా ద్వారా ఇన్ఫెక్షన్ బారిన పడే ప్రమాదం ఎక్కువగా ఉంటుంది. వారి క్యాప్సులర్ పాలిసాకరైడ్ యొక్క ఇమ్యునోకెమిస్ట్రీ ప్రకారం, S. న్యుమోనియా 90 కంటే ఎక్కువ సెరోటైప్లుగా విభజించబడింది. అనేక ఉపరితల ప్రోటీన్లు S. న్యుమోనియాపై ఉన్నాయి ఉదా. ఉపరితల ప్రోటీన్ A, న్యుమోలిసిన్, హైలురోనేట్ లైస్ మొదలైనవి. క్యాప్సూల్ న్యుమోకాకికి ప్రధాన వైరస్ కారకం మరియు ఇది హోస్ట్ యొక్క రోగనిరోధక వ్యవస్థ ద్వారా ఫాగోసైటోసిస్ నుండి బ్యాక్టీరియాను నిరోధిస్తుంది. వివిధ క్లినికల్ ట్రయల్స్ మరియు ప్రయోగాలలో రక్షిత రోగనిరోధక ప్రతిస్పందనను ప్రాంప్ట్ చేసే వారి సామర్థ్యాన్ని కూడా కొన్ని యాంటిజెనిక్ డిటర్మినేట్లు అధ్యయనం చేశాయి. S. న్యుమోనియా యొక్క జనాభా జీవశాస్త్రం సరిగా అర్థం కాలేదు. చాలా సమస్యలు మాలిక్యులర్ క్యారెక్టరైజేషన్ ద్వారా ఉత్పన్నమవుతాయి, క్యారేజ్ నుండి మరియు వివిధ డిస్క్లోజర్ న్యుమోకాకల్ వ్యాధుల నుండి బాగా నమూనా చేయబడిన జనాభా. దీనిని పరిష్కరించడానికి, ఒక మల్టీలోకస్ సీక్వెన్స్ టైపింగ్ స్కీమ్ మరియు 295 ఐసోలేట్ల నుండి ఏడు హౌస్కీపింగ్ లొకి యొక్క 450 bp శకలాలను క్రమం చేయడం ద్వారా డేటాబేస్ అభివృద్ధి చేయబడింది. సెవెన్ లోకీల అల్లెలిక్ కలయిక సీక్వెన్స్ రకం లేదా అల్లెలిక్ ప్రొఫైల్ను ఇస్తుంది. ఈ టైపింగ్ స్కీమ్ తెలిసిన జన్యుసంబంధమైన న్యుమోకాకిని ఉపయోగించి ధృవీకరించబడింది మరియు >6 బిలియన్ సీక్వెన్స్ రకాన్ని పరిష్కరించగలదు. మల్టీలోకస్ సీక్వెన్స్-టైపింగ్ స్కీమ్ న్యుమోకాకి యొక్క క్యారెక్టరైజేషన్కు శక్తివంతమైన కొత్త విధానాన్ని కేటాయిస్తుంది, ఎందుకంటే ఇది ప్రయోగశాలల మధ్య ఎలక్ట్రానిక్గా పోర్టబుల్ అయ్యే మాలిక్యులర్ టైపింగ్ డేటాను అందిస్తుంది మరియు ఈ జీవుల జనాభా మరియు పరిణామాత్మక జీవశాస్త్రం యొక్క అంశాలను పరిశీలించడానికి ఉపయోగించవచ్చు. ఈ ప్రాజెక్ట్లో, ఏది వేగంగా పెరుగుతోందో తనిఖీ చేయడానికి మేము S.pneumoniae యొక్క రెండు వేర్వేరు జాతులను పోల్చాము మరియు ఫినోటైప్ మరియు జన్యురూపం ఆధారంగా ఇన్వాసివ్ మరియు నాన్-ఇన్వాసివ్ జాతుల మధ్య వ్యత్యాసాన్ని గమనించాము.