జీన్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

రిఫ్రిజిరేటెడ్ ట్యునీషియన్ ముక్కలు చేసిన పచ్చి గొడ్డు మాంసం నుండి వేరుచేయబడిన కార్నోబాక్టీరియం డైవర్జెన్స్ యొక్క ఫినోటైపిక్ మరియు జెనోటైపిక్ క్యారెక్టరైజేషన్

తౌరయా మొక్రానీ, ఇనెస్ ఎస్సిద్, మ్నాసర్ హస్సౌనా, లచ్చెబ్ జిహెనే, ఘ్రామ్ అబ్దేల్‌జలీల్ మరియు అహ్లెమ్ జౌని

కార్నోబాక్టీరియం డైవర్జెన్స్ యొక్క ఆరు సైకోట్రోపిక్ జాతులు ట్యునీషియా ముక్కలు చేసిన పచ్చి గొడ్డు మాంసం నుండి వేరుచేయబడి 6 ° C వద్ద నిల్వ చేయబడ్డాయి. వారు మొదట బయోకెమికల్ పద్ధతుల ద్వారా గుర్తించబడ్డారు. పరమాణు పద్ధతుల ద్వారా వాటి వర్గీకరణకు ముందు జీవరసాయన ప్రతిచర్యలు మరియు కార్బోహైడ్రేట్ కిణ్వ ప్రక్రియను ఉపయోగించడం. కార్నోబాక్టీరియం డైవర్జెన్స్ యొక్క జాతి అనేది నాన్‌మోటైల్, గ్రామ్-పాజిటివ్ సైకోట్రోపిక్ రాడ్, ఇందులో ఉత్ప్రేరకము, ఆక్సిడేస్ మరియు మన్నిటాల్ లేవు. ఇది pH 9.1 (D-MRS అగర్) వద్ద పెరుగుతుంది, కానీ అసిటేట్ అగర్ (pH ≤ 5.4)పై కాదు. ఈ ఐసోలేట్‌లన్నింటికీ, API 50 CHL వ్యవస్థను ఉపయోగించి సమలక్షణ గుర్తింపు, కొన్ని చక్కెరల (గ్లిసరాల్, అమిగ్డాలిన్, అర్బుటిన్, D-ట్రెహలోజ్ మరియు పొటాషియం గ్లూకోనేట్) కిణ్వ ప్రక్రియ సామర్థ్యాలలో వైవిధ్యాన్ని వెల్లడించింది. జాతుల స్థాయిలో ఈ వివిక్త జాతుల గుర్తింపును నిర్ధారించడానికి జాతుల-నిర్దిష్ట పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (PCR) ప్రైమర్‌లు ఉపయోగించబడ్డాయి. అంతేకాకుండా, 16S rRNA జన్యువు యొక్క సీక్వెన్సింగ్ మొత్తం ఆరు ఐసోలేట్‌లను C. డైవర్జెన్‌లుగా గుర్తించినట్లు నిర్ధారించింది. సాధారణంగా మాంసంలో గుర్తించబడిన C. డైవర్జెన్స్ యొక్క ఈ ఆరు జాతులలో అంతర్-నిర్దిష్ట వైవిధ్యాన్ని పరిశోధించడానికి Rep-PCR సాంకేతికత ప్రదర్శించబడింది. Rep-PCR పద్ధతి C. డైవర్జెన్స్ జాతులను వేరు చేసి, వాటి జీవవైవిధ్యాన్ని మరియు వాటి స్పష్టమైన సారూప్యతలను ప్రదర్శిస్తుంది. BOX మరియు REP ప్రైమర్‌లు జాతుల మధ్య వరుసగా 85% మరియు 80% సారూప్యతలతో విస్తరణను అనుమతించాయి. BOXA1R మరియు REP ప్రైమర్‌లు C. డైవర్జెన్స్ జాతుల భేదానికి ఉపయోగపడతాయని నిరూపించబడింది.