జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

హ్యూమన్ హెర్పెస్ సింప్లెక్స్ వైరస్ యొక్క ట్రిప్లెక్స్ క్యాప్సిడ్ ప్రోటీన్ యొక్క అమరిక సారూప్యతపై NW అల్గోరిథం మరియు ANFIS మోడలింగ్

విపన్ కుమార్ సోహ్‌పాల్, అపూర్బా డే మరియు అమర్‌పాల్ సింగ్

హ్యూమన్ హెర్పెస్ సింప్లెక్స్ వైరస్ (HHV) యొక్క ట్రిప్లెక్స్ క్యాప్సిడ్ ప్రొటీన్‌ల యొక్క ఆప్టిమల్ సీక్వెన్స్ సారూప్యత అనేది సంక్లిష్టమైన బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ సమస్య, ఇది అలైన్‌మెంట్ అల్గారిథమ్‌లు, ప్రత్యామ్నాయ మాతృక, గ్యాప్ పెనాల్టీ మరియు గ్యాప్ ఎక్స్‌టెన్షన్ ద్వారా నియంత్రించబడుతుంది. సారూప్యత శోధనకు అవసరమైన అమరిక సారూప్యత మరియు తగిన గణన విధానం కోసం మ్యుటేషన్ మ్యాట్రిక్స్ యొక్క ఖచ్చితమైన ఎంపిక అవసరం. ప్రస్తుత పేపర్ మోడల్‌కు అడాప్టివ్ న్యూరో-ఫజీ ఇన్ఫరెన్స్ సిస్టమ్ (ANFIS) విధానాన్ని ఉపయోగిస్తుంది మరియు PAM మరియు Blosum ప్రత్యామ్నాయ మాత్రికల కోసం అమరిక సారూప్యతను అనుకరిస్తుంది. మ్యుటేషన్ మ్యాట్రిక్స్ మరియు HHV-I మరియు HHV-II యొక్క సీక్వెన్సులు మోడల్ ఇన్‌పుట్ పారామీటర్‌లుగా తీసుకోబడ్డాయి. మోడల్ అనేది మసక అనుమితి, కృత్రిమ న్యూరల్ నెట్‌వర్క్ మరియు అస్పష్టమైన నియమాల కలయిక NW అల్గోరిథం ఉపయోగించి గణన విశ్లేషణ నుండి నేరుగా అభివృద్ధి చేయబడింది. ప్రతిపాదిత మోడలింగ్ విధానం నిర్దిష్ట పరిస్థితులలో గణన విశ్లేషణ ద్వారా పొందిన గమనించిన ఆచరణాత్మక ఫలితాలతో ఆశించిన ఫలితాలను పోల్చడం ద్వారా ధృవీకరించబడుతుంది. ANFIS పరీక్ష యొక్క అనువర్తనం ప్రతిపాదిత నమూనా ద్వారా అంచనా వేయబడిన ప్రత్యామ్నాయ మాతృక 0.5% ప్రాముఖ్యత స్థాయిలో ప్రయోగాత్మక విలువలతో పూర్తిగా ఏకీభవించిందని చూపిస్తుంది.