జీన్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

GWASపై కొత్త దృక్పథం: AIతో ఎంపిక ఒత్తిడి మరియు సరళ బీజగణితం యొక్క దృక్కోణం నుండి తూర్పు ఆసియా జనాభా

మసయుకి కనజావ్

వివిధ మానవ జనాభా సమూహాల లక్షణాలను పోల్చడానికి జీనోమ్ వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీస్ (GWAS) ఉపయోగపడుతుంది. అయినప్పటికీ, మహమ్మారి వంటి బలమైన ఎంపిక ఒత్తిడి ఉన్నప్పుడు జన్యువులు కాలక్రమేణా వేగంగా మారవచ్చు. రోగనిరోధక వ్యవస్థకు సంబంధించిన జన్యు సమాచారం అటువంటి వ్యాధులకు చాలా సున్నితంగా ఉంటుందని భావిస్తారు. అందువల్ల, ప్రామాణిక పూర్తి-జన్యువు GWAS మాత్రమే కాకుండా మరింత వివరణాత్మకమైన, క్రోమోజోమ్-కేంద్రీకృత GWASని కూడా నిర్వహించడం అవసరం కావచ్చు.

ఈ అధ్యయనంలో, మేము రోగనిరోధక వ్యవస్థ జన్యువుల క్రోమోజోమ్‌లను రోగనిరోధక వ్యవస్థకు సంబంధించినవిగా భావించని వాటితో పోల్చాము మరియు తేడాలను పరిశీలించడానికి ప్రతి క్రోమోజోమ్‌లోని SNPల కోసం GWAS ఫలితాలను విశ్లేషించాము. నమూనా పరిస్థితులను సాధ్యమైనంత ఒకేలా ఉంచడానికి, మేము జనాభా కదలికలను సులభంగా అర్థం చేసుకునే కొన్ని సమూహాలకు పోలికలు మరియు విశ్లేషణలను పరిమితం చేసాము మరియు నమూనా పరిమాణాలు వీలైనంత దగ్గరగా ఉండేలా చూసుకున్నాము. మేము టోక్యో (JPT)లో 104 మంది జపనీస్ ప్రజలు, బీజింగ్ (CHB)లో 103 మంది హాన్ చైనీస్ ప్రజలు మరియు దక్షిణ చైనా (CHS)లో 105 మంది మరియు 91 కొరియన్ ప్రజలు (KOR) ఉన్న 403 తూర్పు ఆసియా ప్రజల జనాభాను ఎంచుకున్నాము. ఫలితాలను విశ్లేషించడానికి మరియు పోల్చడానికి PCA మరియు మాన్‌హట్టన్ ప్లాట్లు ఉపయోగించబడ్డాయి.

జపనీస్, చైనీస్ మరియు కొరియన్ జనాభాలు వేర్వేరు సమూహాలుగా ఏర్పడ్డాయి, ప్రధాన తేడాలు గమనించబడ్డాయి. మహలనోబిస్ దూరం మరియు AI ఉపయోగించి PCA మరియు మాన్‌హట్టన్ ప్లాట్ యొక్క చెల్లుబాటు కూడా చర్చించబడింది.