జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

మాలిక్యులర్ మోడలింగ్ అండ్ సిమ్యులేషన్ ఆఫ్ హ్యూమన్ స్టోమాటిన్ అండ్ ప్రిడిక్షన్స్ ఫర్ ఇట్ మెంబ్రేన్ అసోసియేషన్

యోసుకే కొండో, హిదేషి యోకోయామా, ఇకువో మట్సుయి మరియు సతోరు మియాజాకి

స్టోమాటిన్ అనేది మానవ ఎర్ర రక్త కణాలలో మెమ్బ్రేన్ ప్రోటీన్. స్ఫటిక నిర్మాణం, దీనిలో హైపర్‌థెర్మోఫిలిక్ ఆర్కియోన్ పైరోకాకస్ హోరికోషి నుండి మోనోమెరిక్ స్టోమాటిన్ α/β డొమైన్ మరియు సి-టెర్మినల్ α-హెలికల్ సెగ్మెంట్‌ను కలిగి ఉంటుంది, ఇది హోమో-ట్రిమర్‌ను ఏర్పరుస్తుంది మరియు స్టోమాటిన్ మరింత హై ఆర్డర్ హోమో-ఒలిగోమెరిక్ కాంప్లెక్స్‌లుగా నిర్వహించబడుతుంది. , 9- నుండి 12-మెర్స్ కలిగి ఉంటుంది. స్టోమాటిన్ యొక్క పరమాణు విధులను బాగా అర్థం చేసుకోవడానికి, మానవ స్టోమాటిన్ ఎలా ఒలిగోమెరైజ్ చేస్తుంది మరియు కణ త్వచాలతో సంబంధం కలిగి ఉంటుంది అనే పరికల్పన ధృవీకరించబడాలి. హ్యూమన్ స్టోమాటిన్ యొక్క α-హెలికల్ విభాగాల సౌలభ్యాన్ని అంచనా వేయడం ద్వారా స్టోమాటిన్ నిర్మాణం నుండి ఎలాంటి కన్ఫర్మేషన్‌లను రూపొందించవచ్చో ఇక్కడ మేము నివేదిస్తాము. మరియు మానవ స్టోమాటిన్ యొక్క ఒలిగోమెరిక్ నిర్మాణం కణ త్వచాలతో ఎలా సంకర్షణ చెందుతుందో కూడా మేము అనుకరిస్తాము. ఫలితాలు α-హెలికల్ విభాగాలు అనువైన కదలికలను చేయగలవని చూపించాయి; మోనోమర్ యొక్క α-హెలికల్ సెగ్మెంట్ మరియు α/β డొమైన్ ఒక ఫ్లాట్ స్ట్రక్చర్‌ను ఏర్పరుస్తాయి మరియు ట్రైమర్ యొక్క α-హెలికల్ విభాగాలు లిపిడ్ పొరలను చేరుకోగలవు. మానవ స్టోమాటిన్ యొక్క ఫ్లాట్ స్ట్రక్చర్ ఆధారంగా, కణ త్వచాల ఉపరితలంతో సంకర్షణ చెందడానికి మేము ఊహాత్మక ఒలిగోమెరిక్ మోడల్‌ను ప్రతిపాదించాము. ఒలిగోమెరిక్ మోడల్ కణ త్వచానికి మద్దతుగా స్కాఫోల్డింగ్ ప్రొటీన్‌గా స్టోమాటిన్ విధులను బాగా వివరిస్తుంది.