జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

పాశ్చాత్య కెన్యా నుండి ఎంపిక చేయబడిన అడవి గడ్డిలో ఫైటోప్లాస్మా 16S rRNA జన్యువు యొక్క పరమాణు నిర్ధారణ మరియు వర్ణన

ఆడమ్ OJ, Midega CAO, Runo S మరియు ఖాన్ ZR

పశ్చిమ కెన్యాలోని ఫైటోప్లాస్మా సబ్-గ్రూప్ 16SrXI వల్ల ఏర్పడిన నేపియర్ స్టంట్ (Ns) వ్యాధి కారణంగా సున్నా మేత వ్యవస్థల కోసం నేపియర్ గడ్డి (పెన్నిసెట్టమ్ పర్పురుమ్) ఉత్పత్తి 90% వరకు తగ్గించబడింది . కెన్యాలోని అనేక ఇతర అడవి గడ్డి ఫైటోప్లాస్మాస్ ద్వారా సంక్రమించవచ్చని ఊహించబడింది, అది నేపియర్, ఇతర ముఖ్యమైన ఫీడ్‌లు మరియు ఆహార పంటలకు గణనీయమైన ముప్పును కలిగిస్తుంది. ఈ అధ్యయనం 16S రైబోసోమల్ RNA (రిబోన్యూక్లియిక్ యాసిడ్) జన్యువును ఉపయోగించి పశ్చిమ కెన్యాలోని అడవి గడ్డిని సోకుతున్న ఫైటోప్లాస్మా జాతులను గుర్తించి, గుర్తించడానికి ప్రయత్నించింది, అలాగే అక్టోబర్ 2011 మరియు జనవరి 2012లో సేకరించిన 646 అడవి గడ్డి నమూనాలలో ఫైటోప్లాస్మాలను హోస్ట్ చేసే అడవి గడ్డి జాతులను గుర్తించింది. పశ్చిమంలోని బుంగోమా మరియు బుసియా కౌంటీలలో యాదృచ్ఛిక క్రాస్ సెక్షనల్ సర్వే నిర్వహించబడింది కెన్యా DNA సంగ్రహించబడింది మరియు ఫైటోప్లాస్మాను గుర్తించడానికి సమూహ పాలిమరేస్ రియాక్షన్ (nPCR) ఉపయోగించబడింది. సోకిన నేపియర్ పొలాల దగ్గర పెరగడాన్ని గమనించిన ఎనిమిది గడ్డి జాతులలో ఫైటోప్లాస్మా యొక్క రెండు ఉప సమూహాలు కనుగొనబడ్డాయి. నివేదించబడిన రెండు ఫైటోప్లాస్మాలలో ఒకటి మాత్రమే Ns ఫైటోప్లాస్మాకు సంబంధించినది. ఫైటోప్లాస్మా ఇన్ఫెక్షన్ యొక్క నిష్పత్తులు మరియు సేకరించిన గడ్డి జాతుల మధ్య బలమైన సంబంధం ఉంది (p = 0.001). C. డాక్టిలాన్, D. స్కేలరమ్, B. బ్రిజాంతా, పేదరికపు గడ్డి మరియు P. గరిష్టంగా ఇన్‌ఫెక్షన్లు ఎక్కువగా ఉన్నాయి మరియు పశ్చిమ కెన్యాలో సమృద్ధిగా పంపిణీ చేయబడ్డాయి కాబట్టి వైల్డ్ ఫైటోప్లాస్మా హోస్ట్‌లుగా పరిగణించబడ్డాయి. E. ఇండికా మరియు C. సిలియారిస్ చాలా తక్కువగా పంపిణీ చేయబడ్డాయి మరియు తక్కువ ఇన్ఫెక్షన్ రేట్లు ఉన్నాయి. సర్వే స్థానానికి సంక్రమణ నిష్పత్తిలో గణాంకపరంగా గణనీయమైన వ్యత్యాసం ఉంది (p = 0.001). ఫైటోప్లాస్మా ఉప సమూహాలు 16SrXI మరియు 16SrXIV మాత్రమే పశ్చిమ కెన్యాలోని అడవి గడ్డి మధ్య పంపిణీ చేయబడిన ఫైటోప్లాస్మా జన్యురూపాలు. ఫైటోప్లాస్మా సబ్‌గ్రూప్ 16SrXIV ప్రధానంగా C. డాక్టిలాన్ మరియు B. బ్రిజాంత గడ్డిలను మాత్రమే సోకుతుంది, అయితే ఫైటోప్లాస్మా సబ్‌గ్రూప్ 16SrXI విస్తృత స్పెక్ట్రం మరియు పెద్ద సంఖ్యలో అడవి గడ్డిని సోకుతుంది. సాధారణంగా, పశ్చిమ కెన్యాలో ఫైటోప్లాస్మాలను హోస్ట్ చేసే అడవి గడ్డి యొక్క వైవిధ్యం ఉంది. Ns ఫైటోప్లాస్మా కోసం రిజర్వాయర్‌లుగా పనిచేయడం ద్వారా పశ్చిమ కెన్యాలో Ns వ్యాధి వ్యాప్తిలో అధిక రేట్లు గమనించడానికి ఈ హోస్ట్ గడ్డి కారణం కావచ్చు.