బాక్టీరియాలజీ & పారాసిటాలజీ జర్నల్

నైరూప్య

సూక్ష్మజీవుల ప్రొటీజెనోమిక్స్, జీనోమ్ సీక్వెన్స్‌ల అవలాంచ్‌తో భూమిని పొందడం

జీన్ అర్మేన్‌గౌడ్, సెలిన్ బ్లాండ్, జోసెఫ్ క్రిస్టీ-ఒలేజా మరియు గైలైన్ మియోటెల్లో

జీవ వైవిధ్యం యొక్క ప్రాథమిక యూనిట్, జాతులను నిర్వచించడానికి ఏకాభిప్రాయం ఇంకా ప్రొకార్యోట్‌లకు చేరుకోలేదు. సూక్ష్మజీవుల వైవిధ్యాన్ని అంచనా వేయడానికి అధిక-నిర్గమాంశ పరమాణు సాధనాలు ఇప్పుడు అందుబాటులో ఉన్నప్పటికీ, పర్యావరణ నమూనాలలో భారీ మొత్తంలో తక్కువ సమృద్ధిగా ఉన్న జాతుల కారణంగా భూమిపై బ్యాక్టీరియా మరియు ఆర్కియా యొక్క మొత్తం జాతుల సంఖ్యను అంచనా వేయడం ఇప్పటికీ సవాలుగా ఉంది. 1995లో హేమోఫిలస్ ఇన్‌ఫ్లుఎంజా నుండి వచ్చిన మొదటి మొత్తం సెల్యులార్ జన్యువు క్రమం చేయబడినప్పటి నుండి, ఏడు వేలకు పైగా పూర్తి జన్యువులు నివేదించబడ్డాయి. జన్యు శ్రేణుల హిమపాతం అనేక టాక్సాల ప్రతినిధుల యొక్క అసాధారణమైన డాక్యుమెంటేషన్‌కు దారి తీస్తుంది. ఈ జన్యువుల ఉల్లేఖనం కొత్త జన్యు అంచనా సాధనాలతో ఖచ్చితత్వాన్ని పొందినప్పటికీ, ప్రోటీజెనోమిక్స్ కొత్త జన్యువులను కనుగొనడంలో సహాయపడుతుందని నిరూపించబడింది, డొమైన్ సీక్వెన్స్‌లను కోడింగ్ చేయడం మరియు సిగ్నల్ పెప్టైడ్ ప్రాసెసింగ్ వంటి ప్రోటీన్ స్థాయిలో పరిపక్వత సంఘటనలను వర్గీకరించడం యొక్క నిజమైన అనువాద దీక్షా కోడాన్‌ను గుర్తించడం. ఈ నిర్మాణాత్మక ఉల్లేఖనంతో పాటు, ప్రొటీజెనోమిక్స్ కూడా ప్రోటీన్ల పనితీరుపై ముఖ్యమైన అంతర్దృష్టులకు దారి తీస్తుంది. ప్రాథమికంగా, పెద్ద షాట్‌గన్ ప్రోటీమిక్ వ్యూహాలు మరియు అధిక-నిర్గమాంశ టెన్డం మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీని ఉపయోగించడం ద్వారా భారీ ప్రోటీన్ సీక్వెన్స్ డేటాను పొందడంలో ప్రోటీజెనోమిక్స్ ఉంటుంది. అటువంటి ప్రయోగాత్మక డేటా జన్యు ఉల్లేఖనాన్ని మెరుగుపరచడానికి ఉపయోగించబడుతుంది. వివిధ బ్యాక్టీరియాలలో జన్యు శ్రేణుల విపర్యయం లేదా డీనోకాకస్ జాతులలో అనువాదం కోసం నాన్-కానానికల్ స్టార్ట్ కోడన్‌లను ఉపయోగించడం వంటి ఊహించని ఫలితాలు ఇప్పటివరకు నమోదు చేయబడిన అనేక దిద్దుబాట్లలో కొన్ని మాత్రమే. ఈ రోజు, జీవిత వృక్షాన్ని పూర్తిగా కవర్ చేసిన ప్రతినిధుల సమితి యొక్క ప్రొటీజెనోమిక్ విశ్లేషణ నవల జాతుల యొక్క ఖచ్చితమైన ఉల్లేఖనానికి మెరుగైన గ్రౌండ్‌కు దారి తీస్తుంది. ఇది తులనాత్మక జన్యుశాస్త్ర అధ్యయనాలను మెరుగుపరుస్తుంది మరియు దగ్గరి-సంబంధిత జాతులు ఏ విధంగా విభిన్నంగా ఉన్నాయో అంచనా వేయడానికి సహాయపడుతుంది.