జీవశాస్త్రం మరియు వైద్యం

నైరూప్య

లిపోపాలిసాకరైడ్ (LPS) మరియు ప్రోటీన్-LPS కాంప్లెక్స్‌లు: జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్, మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ మరియు బయోఅస్సేస్ ద్వారా గుర్తించడం మరియు వర్ణించడం

యుజెనియో హార్డీ, కారిడాడ్ రోడ్రిగ్జ్ మరియు లూయిస్ ఇ. ట్రుజిల్లో

నిర్దిష్ట గ్రాహకాలతో లిపోపాలిసాకరైడ్ (LPS) పరస్పర చర్య యొక్క ఆవిష్కరణ మరియు లక్షణం మరియు ఫలితంగా ఏర్పడే పాథోఫిజియోలాజికల్ ప్రభావాలు LPS జాతుల సమగ్ర నిర్మాణ విశ్లేషణ. ఈ సంక్షిప్త సమీక్ష LPSలను గుర్తించడం మరియు వర్గీకరించడం కోసం ఇతర జీవరసాయన సాంకేతికతలతో అనుసంధానించబడిన జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్ ఉపయోగాన్ని సంగ్రహించడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది. లిపోపాలిసాకరైడ్ కంకరలు ఒంటరిగా ఉంటాయి లేదా LPSలు మరియు ప్రోటీన్లు/పెప్టైడ్‌లను కలిగి ఉన్న మిశ్రమాలను స్థానిక అగరోజ్ జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్ (NAGE) ద్వారా వేరు చేయవచ్చు, దీని తర్వాత LPSలు ఇమిడాజోల్ మరియు జింక్ లవణాలతో గుర్తించబడతాయి. Coomassie బ్రిలియంట్ బ్లూ R-250తో డబుల్-స్టెయినింగ్ ప్రక్రియ ప్రోటీన్-LPS పరస్పర చర్యలను గుర్తించడం మరియు అధ్యయనం చేయడం కోసం NAGEని ఉపయోగించడాన్ని అనుమతిస్తుంది. కూర్పు విశ్లేషణ కోసం, LPS కంకరలు అధిక రిజల్యూషన్‌తో సర్ఫ్యాక్టెంట్-పాలియాక్రిలమైడ్ జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్ ద్వారా వేరు చేయబడతాయి. జింక్-ఇమిడాజోల్‌తో రివర్స్ స్టెయినింగ్ మరియు జెల్ మైక్రోపార్టికల్స్ నుండి ఎల్యూషన్ తర్వాత, గ్లైకోఫార్మ్-నిర్దిష్ట LPSలు నిర్మాణాత్మక మరియు జీవ విశ్లేషణ కోసం సిద్ధంగా ఉన్నాయి. ఒలిగోశాకరైడ్‌ల యొక్క టెన్డం ఎలక్ట్రోస్ప్రే అయనీకరణ మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ (ESI-MS/MS) ఆధారంగా సీక్వెన్స్ విశ్లేషణ కోసం, LPSలు తేలికపాటి ఆమ్ల జలవిశ్లేషణ, డీఫోస్ఫోరైలేషన్ మరియు పెర్మిథైలేషన్‌కు లోబడి ఉంటాయి. అలాగే, O-డీసీలేటెడ్ LPS ఫారమ్‌లను మాతృక-సహాయక లేజర్ నిర్జలీకరణం/ఫ్లైట్-MS యొక్క అయనీకరణ-సమయం ద్వారా విశ్లేషించవచ్చు. శుద్ధి చేయని LPSల స్పెక్ట్రాతో పోల్చడం ద్వారా, మైక్రోప్యూరిఫైడ్ LPSల మాస్ స్పెక్ట్రా వైవిధ్యతను తగ్గిస్తుంది మరియు సిగ్నల్-టు-నాయిస్ నిష్పత్తులను పెంచుతుంది. ఇంకా, MS కంటే ముందు LPSల యొక్క మైక్రోప్యూరిఫికేషన్ తక్కువ సమృద్ధిగా ఉన్న LPS గ్లైకోఫారమ్‌లను గుర్తించే అధిక సున్నితత్వాన్ని అనుమతిస్తుంది. మైక్రోప్యూరిఫైడ్ LPS భిన్నాలు స్వీయ-సమీకరించిన నానోఅగ్రిగేట్‌లను రూపొందించడానికి ఉపయోగించవచ్చు, వీటిని డైనమిక్ లైట్ స్కాటరింగ్ ద్వారా గుర్తించవచ్చు. లేజర్ డాప్లర్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్ ఆధారంగా కొలతల ద్వారా LPS కంకరల Z-పొటెన్షియల్‌పై O-సైడ్ చైన్ పొడవు యొక్క ప్రభావాన్ని అంచనా వేయవచ్చు. ఈ విధంగా పొందిన గ్లైకోఫార్మ్-నిర్దిష్ట LPSలు రసాయనికంగా చెక్కుచెదరకుండా మాత్రమే కాకుండా జీవశాస్త్రపరంగా కూడా చురుకుగా ఉంటాయి, ఉదా. లిములస్ అమీబోసైట్ లైసేట్ పరీక్ష, TNF-α పరీక్ష మరియు మానవ టోల్-వంటి గ్రాహక 4పై అగోనిస్టిక్ ప్రభావం.