జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

ఫైటోఫ్తోరా సిన్నమోమిలో సైటోస్కెలిటన్ నిర్మాణంలో పాల్గొన్న ఆక్టిన్1, ఆక్టిన్2 మరియు ట్యూబులిన్1 జన్యువుల ఐసోలేషన్ మరియు సీక్వెన్సింగ్

ఐవోన్ ఎమ్ మార్టిన్స్, ఎమ్ కార్మెన్ లోపెజ్, ఏంజెల్ డొమింగ్యూజ్ మరియు ఆల్టినో చౌపినా

ఫైటోఫ్థోరా జాతికి చెందిన ఓమైసెట్స్ వ్యవసాయం మరియు సహజ పర్యావరణ వ్యవస్థలకు వినాశకరమైన ఫంగస్ లాంటి మొక్కల వ్యాధికారకాలు. నార్డెస్టే ట్రాన్స్‌మోంటానో ప్రాంతంలో (ఈశాన్య పోర్చుగల్), కాస్టానియా సాటివా చెస్ట్‌నట్ సంస్కృతి చాలా ముఖ్యమైనది. దాదాపు 1000 హోస్ట్ జాతులతో విస్తృతంగా పంపిణీ చేయబడిన ఫైటోఫ్తోరా జాతులలో ఒకటైన ఫైటోఫ్తోరా సిన్నమోమి వల్ల కలిగే సిరా వ్యాధి కారణంగా అతిపెద్ద ఉత్పాదకత మరియు దిగుబడి విరామం ఏర్పడుతుంది . వ్యాధికారకతకు కారణమయ్యే పరమాణు విధానాల గురించిన జ్ఞానం ఈ వ్యాధికారక యొక్క అనుబంధ వ్యాధులను ఎదుర్కోవడానికి ఒక ముఖ్యమైన సాధనం. P. సిన్నమోమిలో సైటోస్కెలిటన్ నిర్మాణంలో పాల్గొనే act1, act2 మరియు tub1 జన్యువుల పూర్తి ఓపెన్ రీడింగ్ ఫ్రేమ్‌లు (ORFలు) హై-ఎఫిషియన్సీ థర్మల్ అసిమెట్రిక్ ఇంటర్‌లేస్డ్ (HE-TAIL) పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (PCR) ద్వారా సాధించబడ్డాయి. act1 జన్యువు 1128 bp ORFని కలిగి ఉంటుంది, 375 అమైనో ఆమ్లాలు (aa) మరియు 41,972 kDa యొక్క డిడ్యూస్డ్ ప్రోటీన్‌ను ఎన్‌కోడింగ్ చేస్తుంది. act2 ORF 1083 bpని కలిగి ఉంటుంది మరియు 360 aa మరియు 40,237 kDa యొక్క డిడ్యూస్డ్ ప్రోటీన్‌ను ఎన్‌కోడ్ చేస్తుంది. tub1 మొత్తం పొడవు 2263 bp మరియు 49.911 kDa పరమాణు బరువుతో 453 aa ప్రోటీన్‌ను ఎన్‌కోడ్ చేస్తుంది. బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణలు ఆక్టిన్1 అనేది ఫైటోఫ్తోరా ఇన్ఫెస్టాన్స్, ఫైటోఫ్తోరా మెగాస్పెర్మా మరియు ఫైటోఫ్తోరా మెలోనిస్ యొక్క యాక్ట్1 జన్యువులకు ఆర్థోలాగ్ అని చూపిస్తుంది; actin2 అనేది P. ఇన్ఫెస్టాన్స్, Phytophthora brassicae, P. melonis మరియు Pythium splendens యొక్క act2 జన్యువులకు ఆర్థోలాగ్ మరియు tubulin1 అనేది P. ఇన్ఫెస్టాన్స్ మరియు P. క్యాప్సిసి α -tubulin జన్యువులకు అత్యధిక ఆర్థోలజీని చూపుతుంది . మూడు పుటేటివ్ ప్రోటీన్‌ల యొక్క విశ్లేషించబడిన 3D నిర్మాణం X- రే డిఫ్రాక్షన్ ద్వారా పొందిన ఆర్థోలాజస్ ప్రోటీన్‌ల కోసం వివరించిన వాటికి సమానమైన ప్రాదేశిక ఆకృతిని వెల్లడించింది.