జర్నల్ ఆఫ్ ఆక్వాకల్చర్ రీసెర్చ్ & డెవలప్‌మెంట్

నైరూప్య

తూర్పు కోల్‌కతా వెట్‌ల్యాండ్ నుండి వేరుచేయబడిన నైట్రిఫైయింగ్ బాక్టీరియా కోసం amoA మరియు nxrAతో 16S rRNA జన్యు శ్రేణుల తులనాత్మక విశ్లేషణను స్థాపించడానికి పరిచయం: ఒక అంతర్జాతీయ రామ్‌సర్ సైట్

సాహా ఎం, సర్కార్ ఎ మరియు బంధోపాధ్యాయ బి

నత్రజని చక్రం చాలా క్లిష్టమైనది మరియు భూమిపై జీవితానికి చాలా ముఖ్యమైనది. నైట్రోజన్ సైక్లింగ్ ప్రక్రియను నిర్వహించే నైట్రిఫైయింగ్ బ్యాక్టీరియా నీటి నాణ్యత నియంత్రణలో కీలక పాత్ర పోషిస్తుంది, తద్వారా నైట్రిఫైయింగ్ బ్యాక్టీరియా యొక్క జన్యు వైవిధ్యంపై నిఘా మరియు పర్యవేక్షణ కోసం జన్యు వేలిముద్ర డేటాబేస్‌ను సృష్టించడం చాలా ముఖ్యం మరియు వివిధ ప్రాంతాల్లో ఉన్న భేరీల కోసం బయోసెక్యూరిటీ ప్రోటోకాల్‌ను ఏర్పాటు చేయడం కూడా చాలా ముఖ్యం. పశ్చిమ బెంగాల్ యొక్క. ప్రస్తుతం పరిణామ సంబంధాలు మరియు అమ్మోనియా ఆక్సిడైజింగ్ బాక్టీరియా (AOB) మరియు నైట్రేట్ ఆక్సిడైజింగ్ బాక్టీరియా (NOB) యొక్క సహజ వైవిధ్యం ప్రధానంగా 16S rRNA మరియు అమ్మోనియా monooxygenase (Amonia monooxygenase) యొక్క క్రియాశీల సైట్ పాలీపెప్టైడ్ మరియు Nitrite (AmoA) మరియు Nitritete ఆక్సిడోరేడక్టేజ్ (NxrA) లో తూర్పు కోల్‌కతా చిత్తడి నేల. ఈ అధ్యయనం AOB కోసం 16S rRNA మరియు amoA డేటాబేస్‌లను, NOB కోసం nxrA డేటాబేస్‌లను గణనీయంగా విస్తరించింది. అందువల్ల, అమ్మోనియా ఆక్సిడైజర్‌లను గుర్తించడానికి ఫంక్షనల్ మార్కర్‌లలో (amoA లేదా nxrA) లేదా నిర్మాణాత్మక మార్కర్ (16S rDNA) పర్యావరణ అధ్యయనాలలో నిర్దిష్ట జాతులను గుర్తించడానికి ఉపయోగించవచ్చు. ఈ పద్ధతులు సహజ AOB మరియు NOB జనాభాను వర్గీకరించడానికి మరియు వాటి వర్గీకరణ మరియు ఫైలోజెనెటిక్ లక్షణాలను విశ్లేషించడానికి 16S rDNA జన్యువులను ఉపయోగించడాన్ని కలిగి ఉన్నాయి. తులనాత్మక 16S rRNA సీక్వెన్స్ విశ్లేషణ ద్వారా స్థాపించబడిన AOB మరియు NOB ఫైలోజెని యొక్క ప్రస్తుత అవగాహన amoA మరియు nxrA జన్యువులను ఉపయోగించడం ద్వారా స్వతంత్రంగా నిర్ధారించబడుతుంది మరియు ప్రత్యామ్నాయ ఫైలోజెనెటిక్ మార్కర్‌గా నిరూపించబడింది. EKWలో 16S rDNA సీక్వెన్స్ అనాలిసిస్‌తో పాటు AOBలు మరియు NOBలకు ఫంక్షనల్ మార్కర్‌లుగా అమ్మోనియా మోనోఆక్సిజనేస్ సబ్యూనిట్ A జన్యువు (amoA) మరియు నైట్రేట్ ఆక్సిడోరేడక్టేజ్ (nxrA) జన్యువు యొక్క సామర్థ్యాన్ని పరిశోధించడం మా పని యొక్క లక్ష్యం. పర్యావరణ నిఘా కోసం, ప్రస్తుత పరిశోధన పనిలో ఉన్న నైట్రిఫైయింగ్ బ్యాక్టీరియా కోసం ప్రత్యేకమైన amoA మరియు nxrA వంటి జన్యువులు మరింత నమ్మదగిన సాధనం.