జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

డెంగ్యూ వైరస్‌తో సహా ఫ్లావివైరస్ జన్యువులలో పునరావృత శ్రేణుల Imex ఆధారిత విశ్లేషణ

చౌదరి మష్హూద్ ఆలం, ఆసిఫ్ ఇక్బాల్, బబితా తడారి మరియు సఫ్దర్ అలీ

మైక్రోసాటిలైట్‌లు అని కూడా పిలువబడే సింపుల్ సీక్వెన్స్ రిపీట్‌లు (SSRలు), 1-6 న్యూక్లియోటైడ్‌లు రిపీట్ మోటిఫ్, ఇవి ప్రొకార్యోట్‌లు, యూకారియోట్లు మరియు వైరస్‌ల కోడింగ్ మరియు నాన్-కోడింగ్ ప్రాంతాలలో వివిధ రకాల పునరావృతాలలో ఉంటాయి. ప్రస్తుత అధ్యయనం డెంగ్యూ వైరస్‌ను కలిగి ఉన్న 27 ఫ్లావివైరస్ జన్యువులలో సాధారణ శ్రేణి పునరావృత్తులు (SSRలు) పై దృష్టి పెడుతుంది. SSRల వెలుగులోని తులనాత్మక వైరల్ జెనోమిక్స్ కొత్త హోస్ట్‌లకు వైవిధ్యం మరియు అనుకూలతను అర్థం చేసుకోవడంలో మాకు సహాయం చేస్తుంది. 27 అధ్యయనం చేసిన జన్యువుల నుండి మొత్తం 1164 SSR లు మరియు 53 cSSR లు కనుగొనబడ్డాయి. మోనోన్యూక్లియోటైడ్ A అనేది దాదాపు 6 సగటు పంపిణీతో అత్యంత ప్రబలమైన పునరావృత మూలాంశం. దీని తర్వాత G (సగటు పంపిణీ 2). డైన్యూక్లియోటైడ్‌లలో AG/GA రిపీట్ మూలాంశం అధ్యయనం చేయబడిన జన్యువులలో సగటున 14 పంపిణీతో అత్యంత ప్రబలంగా ఉంది. ఫ్లావివైరస్ జన్యువులలో జన్యు పరిణామానికి కారణమయ్యే రెండు ముఖ్యమైన లక్షణాలు లేవు, డైన్యూక్లియోటైడ్ రిపీట్ మోటిఫ్ AT/TA (కనీసం ~0.5 సగటు పంపిణీతో ప్రాతినిధ్యం వహిస్తుంది) మరియు నాన్-కోడింగ్ ప్రాంతాలలో cSSR, ఇదివరకు వివరించలేని మెకానిజమ్‌ల ద్వారా స్థిరమైన జన్యువు లేదా పరిణామాన్ని సూచిస్తుంది. డెంగ్యూ వైరస్ యొక్క ఐసోలేట్‌లలో సంరక్షించబడిన సీక్వెన్స్‌ల ఆవిష్కరణ వైరల్ డయాగ్నస్టిక్స్ కోసం బయోమార్కర్ అభివృద్ధికి ఒక ఆధారాన్ని సూచిస్తుంది.