జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

మొక్కజొన్నలో సహజ ప్రతిఘటన-సంబంధిత మాక్రోఫేజ్ ప్రోటీన్ ( NRAMP ) జన్యు కుటుంబం యొక్క కరువు ఒత్తిడికి ప్రతిస్పందనగా సిలికో ఫంక్షనల్ ప్రిడిక్షన్ మరియు ఎక్స్‌ప్రెషన్ అనాలిసిస్‌లో

Md. గోలం రబీ, Md. మోస్తఫా కమల్, Md. సాకిబ్ హసన్, Md. మొసబ్బిర్ హొస్సేన్, Md. నుమాన్ ఇస్లాం*

సహజ ప్రతిఘటన-సంబంధిత మాక్రోఫేజ్ ప్రోటీన్లు ( NRAMPలు ) మెటల్ హోమియోస్టాసిస్‌ను నిర్వహించడానికి మెటల్ ట్రాన్సిషన్ ట్రాన్స్‌పోర్టర్‌లుగా మొక్కలలో పనిచేస్తాయి. మొక్కజొన్న NRAMP ల జన్యు-వ్యాప్త గుర్తింపు మరియు ఫంక్షనల్ ప్రిడిక్షన్ ఇంకా అధ్యయనం చేయబడలేదు. జన్యు-వ్యాప్త విశ్లేషణ మొక్కజొన్నలో ఏడు (ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, ZmNRAMP3, ZmNRAMP4, ZmNRAMP5, ZmNRAMP6, ZmNRAMP7 ) ప్రొటీన్‌లను 29.08 ( ZmNRAMP2 ) నుండి 63.25 kNDaMP ( ZmNRAMP2 ) వరకు కలిగి ఉంటుంది. ZmNRAMP1 మరియు ZmNRAMP3 మినహా , అన్ని ZmNRAMPలు అవసరమైన ప్రోటీన్లు (7 కంటే ఎక్కువ ఐసోఎలెక్ట్రిక్ పాయింట్లు). ZmNRAMP లలో ఇంట్రాన్‌ల సంఖ్య 1 నుండి 13 వరకు ఉంటుంది, ఇది మొక్కజొన్న మరియు అరబిడోప్సిస్ మధ్య ఫైలోజెనెటిక్ సమూహాలలో (A మరియు B) దాదాపు స్థిరంగా ఉంటుంది. అన్ని ప్రోటీన్లు మొక్కజొన్న మరియు అరబిడోప్సిస్ మధ్య సమూహాలలో స్థిరంగా ఉండే బహుళ మూలాంశాలను (6 నుండి 10 వరకు) చూపించాయి. మేము ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ డొమైన్‌లు, సిస్-రెగ్యులేటరీ ఎలిమెంట్స్, క్రోమోజోమల్ మ్యాపింగ్ మరియు ముఖ్యమైన క్రియాత్మక లక్షణాలను వెల్లడించే జీన్ ఆన్టాలజీ ఉల్లేఖనాన్ని కూడా నిర్వహించాము. ఏపుగా మరియు పునరుత్పత్తి కణజాలాలలో గణనీయంగా పెరిగిన ZmNRAMPలు ( ZmNRAMP1, ZmNRAMP2 మరియు ZmNRAMP4 ) హెవీ మెటల్ శోషణ, రవాణా మరియు హోమియోస్టాసిస్‌లో ముఖ్యమైన పాత్ర పోషిస్తాయి. కరువు ఒత్తిడి సమయంలో, cc యొక్క గణనీయమైన నియంత్రణ ( ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, ZmNRAMP4, మరియు ZmNRAMP7 ) మొక్కజొన్నలో కరువును తట్టుకోవడం లేదా అలవాటు చేయడంలో పాత్ర పోషిస్తుంది.