జర్నల్ ఆఫ్ మైక్రోబియల్ & బయోకెమికల్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

ట్రైకోడెర్మా spp యొక్క గుర్తింపు. DNA బార్‌కోడ్ మరియు సెల్యులోలిటిక్ యాక్టివిటీ కోసం స్క్రీనింగ్ ద్వారా

అబ్దెల్మెగిద్ ఐ ఫహ్మీ, రాగా ఎ ఈసా, ఖలీల్ ఎ ఎల్-హల్ఫావి, హనాఫీ ఎ హమ్జా మరియు మహమూద్ ఎస్ హెల్వా

ఈజిప్టులోని నైలు డెల్టాలోని వివిధ ప్రాంతాల నుండి ట్రైకోడెర్మా యొక్క ఐసోలేట్‌ల జాతుల గుర్తింపు నిర్వహించబడింది మరియు వాటి సెల్యులోలిటిక్ కార్యకలాపాలు విశ్లేషించబడ్డాయి. పదనిర్మాణ లక్షణాల ఆధారంగా, 75% ఐసోలేట్లు జాతుల స్థాయికి గుర్తించబడ్డాయి మరియు అవి నాలుగు మొత్తం సమూహాలుగా విభజించబడ్డాయి. ట్రైకోడెర్మా జాతులను ఖచ్చితంగా గుర్తించడానికి పదనిర్మాణ లక్షణము మాత్రమే సరిపోదు ఎందుకంటే అవి సాపేక్షంగా కొన్ని పదనిర్మాణ అక్షరాలు మరియు పరిమిత వైవిధ్యాన్ని కలిగి ఉంటాయి, ఇవి ఐసోలేట్‌ల అతివ్యాప్తి మరియు తప్పుగా గుర్తించబడతాయి. అందువల్ల, పదనిర్మాణ లక్షణాల పరిమితులను భర్తీ చేయడానికి పరమాణు సాంకేతికతను ఉపయోగించాల్సిన అవసరం ఉంది. 5.8S-ITS ప్రాంతం యొక్క DNA సీక్వెన్సింగ్ నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌లు ITS1 మరియు ITS4 ఉపయోగించి నిర్వహించబడింది. BLAST ప్రోగ్రామ్‌ని ఉపయోగించి జెన్‌బ్యాంక్‌లో జమ చేసిన సీక్వెన్స్‌లతో 5.8S-ITS ప్రాంతం యొక్క సీక్వెన్స్‌లను పోల్చడం ద్వారా అన్ని ఐసోలేట్‌లను కనీసం 99% హోమోలజీ శాతంతో జాతుల స్థాయికి గుర్తించవచ్చు. అదనంగా, TrichOKEY శోధన సాధనం Genbank యొక్క విశ్వసనీయతను అంచనా వేయడానికి ఉపయోగించబడింది మరియు ఫలితాలు BLAST ఫలితాలతో 92% ఒప్పందంలో ఉన్నాయి. డేటా ఇరుకైన జాతుల వైవిధ్యాన్ని సూచించింది మరియు రెండు ప్రధాన జాతులు ప్రధానంగా ఉన్నాయి; T. లాంగిబార్చియాటం మరియు T. హర్జియానం. న్యూక్లియోటైడ్‌ల పంపిణీ, అలాగే (G+C) ఐసోలేట్‌ల ప్రాంతంలోని (G+C) కంటెంట్, విస్తృత శ్రేణి ఇంటర్‌స్పెసిస్ వైవిధ్యాన్ని సూచించింది. చివరగా, సెల్యులోజ్-ఆజూర్ పద్ధతిని ఉపయోగించి వాటి మొత్తం సెల్యులేస్ కార్యకలాపాల కోసం, అవిసెల్ పద్ధతిని ఉపయోగించి ఎక్సోగ్లుకనేస్ కార్యకలాపాల కోసం మరియు కార్బాక్సిమీథైల్ సెల్యులోజ్ (CMC) మరియు యాసిడ్ వాపు సెల్యులోజ్ పద్ధతులను ఉపయోగించి ఎండోగ్లుకనేసెస్ కార్యకలాపాల కోసం ఐసోలేట్‌లు అంచనా వేయబడ్డాయి. పర్యవసానంగా, సెల్యులోలిటిక్ సామర్థ్యం కోసం ఉపయోగించే 28 ఐసోలేట్‌లలో పదకొండు ఐసోలేట్‌లు ఉత్తమ ఐసోలేట్‌లుగా ఎంపిక చేయబడ్డాయి.