జర్నల్ ఆఫ్ మైక్రోబియల్ & బయోకెమికల్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

వర్చువల్ స్క్రీనింగ్ అప్రోచ్ ద్వారా నవల హెపటైటిస్ సి వైరస్ NS3-4A ప్రోటీజ్ ఇన్హిబిటర్స్ యొక్క గుర్తింపు

అనీష్ కుమార్, రష్మీ గుప్తా, కనికా వర్మ, క్షితిజా అయ్యర్, శాంతి వి మరియు కె రామనాథన్

హెపటైటిస్ సి వైరస్ (HCV) ప్రపంచవ్యాప్తంగా సిర్రోసిస్ మరియు కాలేయ క్యాన్సర్‌కు ప్రధాన కారణం. HCV యొక్క ప్రతిరూపణ మరియు వైరల్ పాలీప్రొటీన్ పరిపక్వత అనేది పాలీప్రొటీన్ పూర్వగామిని 10 వైరల్ ప్రోటీన్‌లుగా విభజించడంపై ఆధారపడి ఉంటుంది. NS3-4A సెరైన్ ప్రోటీజ్ పాలీప్రొటీన్ యొక్క నిర్మాణేతర ప్రాంతాన్ని ఐదు జంక్షన్‌లలో నాలుగు వద్ద విడదీస్తుంది, తద్వారా యాంటీవైరల్ ఇన్హిబిటర్ల అభివృద్ధికి ఇది మంచి లక్ష్యం. HCV NS3/4A ప్రోటీజ్ యొక్క అనేక నిరోధకాలు క్లినికల్ ట్రయల్‌లో ఉన్నాయి మరియు వైరల్ ఇన్‌ఫెక్షన్ రేటులో గణనీయమైన తగ్గింపును సూచించే మెరుగుదల. అయినప్పటికీ, చాలా PIలు చికిత్స సమయంలో ప్రతిఘటన సంబంధిత రూపాంతరాలను అభివృద్ధి చేస్తాయి మరియు ఒకటి లేదా రెండు HCV జన్యురూపాలకు పరిమితం చేయబడ్డాయి. రెండవ తరం PI, MK-5172, మాత్రమే మినహాయింపు, ఇది మొదటి తరం PIలకు ప్రతిఘటనతో అనుబంధించబడిన చాలా వైవిధ్యాలను శక్తివంతంగా నిరోధిస్తుంది మరియు ఇది పాన్-జెనోటైపిక్. ఈ అధ్యయనంలో, మేము అత్యంత శక్తివంతమైన నిరూపించబడిన ప్రోటీజ్ ఇన్హిబిటర్, MK-5172ని ఉపయోగించి సారూప్యత శోధన ఆధారంగా శక్తివంతమైన ప్రధాన సమ్మేళనం(ల)ను పరిశోధించాము. మేము అణువుల వంటి సీసంని గుర్తించడానికి NCBIలో అందుబాటులో ఉన్న PubChem డేటాబేస్‌ని ఉపయోగించి వర్చువల్ స్క్రీనింగ్ పద్ధతులను ప్రదర్శించాము. డేటాబేస్ 95% సారూప్యత శోధన కోసం 32 హిట్‌లను అందించింది మరియు స్క్రీన్ చేయబడిన సమ్మేళనాల కోసం ఫార్మకోకైనటిక్ విశ్లేషణ (ADME) నిర్వహించబడింది. ఈ నిర్మాణ ఆధారిత ఔషధ రూపకల్పన NS3/4A ప్రోటీజ్‌కు వ్యతిరేకంగా మెరుగ్గా పని చేయగల మూడు ప్రధాన సమ్మేళనాలను గుర్తించింది.