సింగిల్ సెల్ బయాలజీ

నైరూప్య

LCM- ప్రోటీమిక్స్ విశ్లేషణను ఉపయోగించి టొమాటో మైక్రోస్పోర్స్‌లో వేడి-ప్రేరిత ప్రోటీమ్‌ల గుర్తింపు

Li H, Zhu Y, Rangu M, Wu X, Bhatti S, Zhou S, Yang Y, Fish T మరియు Thannhauser TW

పుప్పొడి అభివృద్ధి వేడి ఒత్తిడికి (HS) చాలా అవకాశం ఉంది మరియు ఇన్వియబుల్ పుప్పొడి ఉత్పత్తి మొక్కలలో విత్తనం మరియు పండ్లలో తగ్గింపుకు కారణమవుతుంది. ఈ అధ్యయనం HS- ప్రేరిత పుప్పొడి ప్రోటీన్‌లను మరియు టొమాటో (సోలనం లైకోపెర్సికమ్)లో అనుబంధిత జీవ ప్రక్రియలను గుర్తించడానికి నిర్వహించబడింది. టొమాటో 'మైక్రో-టామ్' మొక్కలు వేడి చికిత్స కోసం రెండు వారాల పాటు 32°C//22°C (పగలు/రాత్రి, 12/12 గం) కింద పొదిగేవి, మరియు చికిత్స చేయని నియంత్రణ ప్లాంట్లు అదే సమయ వ్యవధిలో పొదిగేవి 25°C /22°C. 5 మిల్లీమీటర్ల పొడవు గల పూల మొగ్గలు హీట్ సెన్సిటివ్ యూనియూక్లేట్ మైక్రోస్పోర్‌లను కలిగి ఉన్నట్లు నిర్ధారించబడింది. లేజర్ క్యాప్చర్ మైక్రోడిసెక్షన్ (LCM) ఉపయోగించి పుప్పొడి కణాలు పండించబడ్డాయి మరియు అధిక పీడనం మరియు వాక్యూమ్‌లో ఒక-దశ పద్ధతిని ఉపయోగించి ప్రోటీన్ సంగ్రహించబడింది. దాదాపు 60,000 LCMహార్వెస్టెడ్ మైక్రోస్పోర్ కణాలు 18-20 μg ప్రొటీన్‌లను అందించాయి. టెన్డం మాస్ ట్యాగ్‌లు (TMT) ప్రోటీమిక్స్ విశ్లేషణ మొత్తం 6018 ప్రోటీన్‌లను గుర్తించింది, 4784 ప్రోటీన్‌లు పరిమాణీకరించబడ్డాయి, 37 ప్రోటీన్‌లు HS అప్-రెగ్యులేటెడ్ గణనీయంగా మార్చబడిన ప్రోటీన్‌లుగా (SCPలు) మరియు 83 ప్రోటీన్‌లు HS డౌన్ (dn)-నియంత్రిత SCPలుగా గుర్తించబడ్డాయి. ప్లాంట్ మెట్‌జెన్‌మ్యాప్ సిస్టమ్‌ను ఉపయోగించి తదుపరి విశ్లేషణలో HS అప్-రెగ్యులేటెడ్ SCPలు హీట్ అక్లిమేషన్, పుప్పొడి గోడ నిర్మాణం, ప్రోటీన్ ఫోల్డింగ్/రీఫోల్డింగ్ జీన్ ఆన్టాలజీ (GO) బయోలాజికల్ ప్రాసెస్‌లలో సమృద్ధిగా ఉన్నాయని మరియు HS dn- నియంత్రిత SCPలు కార్బోహైడ్రేట్‌లో ఉంచబడ్డాయి. ఉత్ప్రేరకము మరియు డి-నోవో ప్రోటీన్ బయోసింథసిస్ GO నిబంధనలు. మైటోసిస్, ఆక్సీకరణ ఒత్తిళ్లకు నిరోధకత మరియు కార్బోహైడ్రేట్ మరియు లిపిడ్ జీవక్రియ ప్రక్రియలు వంటి జీవ ప్రక్రియలు HS up- మరియు dn-నియంత్రిత SCPలు రెండింటినీ కలిగి ఉంటాయి. HS-ప్రేరిత పుప్పొడి ప్రోటీమ్‌ల గుర్తింపులో LCM-TMT ప్రోటీమిక్స్ వర్క్‌ఫ్లో అత్యంత సమర్థవంతంగా పనిచేస్తుందని ఈ ఫలితాలు సూచిస్తున్నాయి. ఈ HS ప్రేరిత SCPలు టొమాటో పుప్పొడి యొక్క వేడిని తట్టుకునే శక్తిని అన్వేషించడానికి ఉపయోగించబడతాయి. ప్రోటీమిక్స్ డేటా ఐడెంటిఫైయర్ PXD010218తో ProteomeXchange ద్వారా అందుబాటులో ఉంటుంది.