జర్నల్ ఆఫ్ మైక్రోబియల్ & బయోకెమికల్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

ఫ్లావోబాక్టీరియం కాలమ్‌నేర్‌లో gtf, norB, మరియు trx జన్యువుల గుర్తింపు మరియు లక్షణం

యిన్ఫెంగ్ జాంగ్ మరియు కోవడోంగా R. అరియాస్

ఫ్లావోబాక్టీరియం కాలమ్‌లోని షాట్‌గన్ జెనోమిక్ లైబ్రరీ నుండి మూడు జన్యువులు వైరలెంట్ స్ట్రెయిన్ ALG-00-530 గుర్తించబడ్డాయి, వర్గీకరించబడ్డాయి మరియు సంబంధిత జాతుల నుండి పుటేటివ్ వైరలెన్స్ జన్యువులకు క్రమం సారూప్యత ఆధారంగా అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ కోసం ఎంపిక చేయబడ్డాయి. ఈ జన్యువులు: గ్లైకోసైల్ట్రాన్స్‌ఫేరేస్ (gtf), నైట్రిక్ ఆక్సైడ్ రిడక్టేజ్ (norB) మరియు థియోరెడాక్సిన్ (trx). జెనోమోవర్స్ I మరియు II నుండి జాతులతో సహా 30 F. స్తంభాల జాతుల సేకరణ ఈ జన్యువుల ఉనికి కోసం పరీక్షించబడింది. జాతుల అంతటా gtf, norB మరియు trx యొక్క పంపిణీ నమూనాలు ఏకరీతిగా లేవు. ప్రతి జన్యువుకు జెనోమోవర్ల మధ్య న్యూక్లియోటైడ్ సీక్వెన్స్ వైవిధ్యం గమనించబడింది; అయినప్పటికీ, అదే జెనోమోవర్‌లోని జాతులు ఒకే విధమైన జన్యు శ్రేణులను పంచుకుంటాయి. జన్యు వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ కోసం రెండు జెనోమోవర్‌ల నుండి F. స్తంభాల తొమ్మిది జాతులు ఎంపిక చేయబడ్డాయి. ఎంచుకున్న జాతులు ఒకే విధమైన పరిస్థితులలో విట్రోలో పెరిగినప్పుడు ఈ జన్యువుల వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్ మారుతూ ఉంటుంది. ALG-00-530, అధిక వైరస్ జాతి, ప్రామాణిక పెరుగుతున్న పరిస్థితులు, ఇనుము-పరిమిత పరిస్థితులు మరియు ఛానల్ క్యాట్‌ఫిష్ నుండి చర్మ వివరణల సమక్షంలో జన్యు వ్యక్తీకరణ పోలిక కోసం ఎంపిక చేయబడింది. ALG-00-530 వివిధ పరిస్థితులలో పొదిగినప్పుడు NorB మరియు trx జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు మారుతూ ఉంటాయి.