బయోకెమిస్ట్రీ & అనలిటికల్ బయోకెమిస్ట్రీ

నైరూప్య

మాక్రోమోలిక్యులర్ రిఫైన్‌మెంట్‌లో సెలెనోమెథియోనిన్‌ల నిర్వహణ

Jarosław Błaszczyk

ప్రోటీన్ డేటా బ్యాంక్‌లో, సెలీనియం-ఉత్పన్న ప్రోటీన్‌ల నుండి నిర్ణయించబడిన ఎక్స్-రే నిర్మాణాలను మనం కనుగొనవచ్చు, కానీ డిపాజిట్ చేయబడిన కోఆర్డినేట్‌లు, మన ఆశ్చర్యానికి, స్థానిక మెథియోనిన్‌లను కలిగి ఉంటాయి. రసాయన చర్య సమయంలో స్థానిక మెథియోనిన్‌లను సెలెనోమెథియోనిన్‌లతో పూర్తిగా భర్తీ చేయకపోవడం వల్ల సమస్య సంభవించవచ్చు. అటువంటి నమూనా నుండి క్రిస్టల్ వృద్ధి చెంది, తరువాత X- రే విశ్లేషణకు గురైనప్పుడు, అది స్థానిక సల్ఫర్ యొక్క పాక్షిక ఉనికిని చూపుతుంది. ఈ కాగితం సెలెనోమెథియోనిన్స్ యొక్క శుద్ధీకరణను ఎలా నిర్వహించాలో చర్చలో ఒక వాయిస్. ఈ పని యొక్క ఉద్దేశ్యం ఏమిటంటే, సెలెనోమెథియోనిన్‌లను పూర్తిగా స్థానిక మెథియోనిన్‌లుగా ఎందుకు శుద్ధి చేయలేదో వివరించడం, ముఖ్యంగా అధిక రిజల్యూషన్‌లో నిర్ణయించబడిన స్థూల కణ నిర్మాణాలలో. సెలీనియం మరియు సల్ఫర్ వేర్వేరు రసాయన మూలకాలు కాబట్టి ఇది చాలా ముఖ్యం. సరైన అణువు రకం యొక్క శుద్ధీకరణ యొక్క ప్రాముఖ్యతను వివరించడానికి, రచయిత సల్ఫర్ లేదా సెలీనియం కలిగిన తన గతంలో నివేదించిన చిన్న సేంద్రీయ నిర్మాణాల నుండి ప్రధానంగా సేకరించిన సాక్ష్యాలను అందిస్తుంది. సెలీనియం కలిగిన ఎక్స్‌రే నిర్మాణాలు వాటి సల్ఫర్-కలిగిన అనలాగ్‌లతో ఎప్పుడూ ఒకేలా ఉండవని రచయిత నొక్కి చెప్పారు. అవి కనీసం సంబంధిత బాండ్ పొడవులో తేడా ఉంటాయి. బహిరంగంగా అందుబాటులో ఉన్న రెండు ఎక్స్-రే నిర్మాణాలు తిరిగి శుద్ధి చేయబడ్డాయి, ఒక చిన్న అణువు మరియు ఒక స్థూల అణువు, ఇందులో పరమాణు రకం ఉద్దేశపూర్వకంగా మార్చబడింది. రసాయనికంగా సరికాని అణువు రకం యొక్క శుద్ధీకరణ పరమాణు స్థానభ్రంశం పారామితుల యొక్క నాన్-నేచురల్ ప్రవర్తనను అందించింది. సరికాని పరమాణు రకాలను కలిగి ఉన్న నిర్మాణాలు ప్రయోగాత్మక డేటాను సూచించలేవు కానీ నమూనాలుగా మాత్రమే పనిచేస్తాయని రచయిత నిర్ధారించారు. PDBలో ఉదాహరణలు ఉన్నాయి, ఇది పూర్తిగా Se-Met ఉత్పన్నం కాని ప్రోటీన్‌లలోని సెలెనోమెథియోనిన్‌లను ఏకపక్షంగా భావించిన 100% కంటే తక్కువ ఆక్యుపెన్సీలతో శుద్ధి చేయవచ్చని చూపిస్తుంది. ఇది కోఆర్డినేట్‌లలో S పరమాణువులను కలిగి ఉన్న పైన పేర్కొన్న Se-Met నిర్మాణం యొక్క వివిధ రీ-రిఫైన్‌మెంట్‌లను నిర్వహించడానికి రచయితను ప్రేరేపించింది. ఈ రీ-రిఫైన్‌మెంట్‌లలో, సెలెనోమెథియోనిన్‌లు వేర్వేరు పద్ధతులలో నిర్వహించబడతాయి మరియు ఫలితాలు పోల్చబడతాయి. రచయిత రసాయన గుర్తింపులు, సెలీనియం మరియు సల్ఫర్, పాక్షిక ఆక్రమణలతో, ఒక పద్ధతిగా శుద్ధి చేయాలని సూచించారు.