జర్నల్ ఆఫ్ కార్సినోజెనిసిస్ & మ్యూటాజెనిసిస్

నైరూప్య

IRF1 బైండింగ్ సైట్‌ల యొక్క జీనోమ్-వైడ్ ఐడెంటిఫికేషన్ సెల్ డెత్ అసోసియేటెడ్ జీన్స్ వద్ద విస్తృతమైన ఆక్యుపెన్సీని వెల్లడిస్తుంది

అలెశాండ్రో రెట్టినో మరియు నికోల్ ఎమ్ క్లార్క్

IRF1 అనేది ఇంటర్‌ఫెరాన్ సిగ్నలింగ్‌లో ప్రమేయం ఉన్న ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ కారకం మరియు ట్యూమర్ సప్రెసర్ యాక్టివిటీని కలిగి ఉన్నట్లు చూపబడింది. IRF1చే నియంత్రించబడే మార్గాలను సమగ్రంగా గుర్తించడానికి, మేము IRF1 జీనోమ్-వైడ్ యొక్క జన్యు లక్ష్యాలను అంచనా వేయడానికి క్రోమాటిన్ ఇమ్యునోప్రెసిపిటేషన్ తర్వాత భారీ-సమాంతర సీక్వెన్సింగ్ (ChIP-seq)ని ఉపయోగించాము. మేము రొమ్ము క్యాన్సర్ కణాలలో మొత్తం 17,416 బైండింగ్ సంఘటనలను గుర్తించాము. IFNgamma (ఇంటర్ఫెరాన్-గామా) చికిత్స తర్వాత బైండింగ్ సైట్‌ల ఫంక్షనల్ వర్గీకరణ 'అపోప్టోసిస్' లేదా 'సెల్ డెత్' అనేది అత్యంత సుసంపన్నమైన లక్ష్య ప్రక్రియ అని నిర్ధారించింది. IRF1 ద్వారా కట్టుబడి ఉన్న క్రోమోజోమ్ ప్రాంతాల యొక్క మూలాంశ ఆవిష్కరణ విశ్లేషణ అపోప్టోసిస్, DNA నష్టం మరియు రోగనిరోధక ప్రక్రియలతో పరస్పర సంబంధం ఉన్న అనేక ప్రత్యేక మూలాంశాలను గుర్తించింది. IRF1-ట్రాన్స్‌డ్యూస్డ్ సెల్స్ లేదా IFN-గామా ట్రీట్ చేసిన ఫైబ్రోబ్లాస్ట్‌ల నుండి GEO ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ డేటా యొక్క విశ్లేషణ IFN-ట్రీట్ చేయబడిన సెల్‌లలో IRF1-బౌండ్ టార్గెట్‌లు సానుకూల ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ ప్రతిస్పందనతో సంబంధం కలిగి ఉన్నాయని సూచిస్తుంది. వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ నుండి అనేక సుసంపన్నమైన లక్ష్య జన్యువులు అపోప్టోసిస్‌తో సంబంధం కలిగి ఉంటాయి. ముఖ్యముగా, ఈ డేటా IRF1 యొక్క ముఖ్యమైన విధి క్యాన్సర్-వ్యతిరేక అపోప్టోటిక్ మార్గాల నియంత్రణ అని సూచిస్తుంది మరియు ఇది ట్యూమర్ సప్రెసర్‌గా IRF1 పాత్రను బలపరుస్తుంది.