జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

నిల్వ పరిస్థితిలో సిట్రస్ నుండి వేరు చేయబడిన పెన్సిలియా మధ్య జన్యు వైవిధ్యం

అహ్మద్ అలీ షాహిద్, మెహ్రా ఆజం, ముహమ్మద్ అలీ, కిరణ్ నవాజ్ మరియు మోజమ్ అనీస్

పాకిస్తాన్ ప్రపంచంలోని కినో (మాండరిన్) మరియు నారింజలను 2.1 మిలియన్ టన్నులతో ఆరవ అతిపెద్ద ఉత్పత్తిదారుగా ఉంది. ఈ పరిశోధనలో, లాహోర్‌లోని పండ్లు మరియు కూరగాయల మార్కెట్‌లను సందర్శించారు మరియు నలభై సోకిన సిట్రస్ నమూనాలను సేకరించి, ఉపరితలంపై క్రిమిరహితం చేసి, బంగాళాదుంప డెక్స్‌ట్రోస్ అగర్ మాధ్యమంలో ఒంటరిగా ఉంచారు. మైక్రోస్కోపీ మరియు కాలనీ లక్షణాల ప్రకారం పెన్సిలియం (పి. డిజిటమ్, పి. ఎక్స్‌పాన్సమ్, పి. బయోర్జియానం) జాతికి చెందిన ఐదు జాతులు గుర్తించబడ్డాయి. ప్రైమర్‌లు ITS 1 మరియు ITS4 మరియు శిలీంధ్రాల 5.8S rRNA జన్యువులను ఉపయోగించడం ద్వారా జెనోమిక్ DNA వేరుచేయబడింది మరియు అంతర్గత లిప్యంతరీకరణ స్పేసర్ (ITS) విస్తరించబడింది. శుద్ధి చేయబడిన మరియు విస్తరించిన PCR ఉత్పత్తులు తరువాత క్రమం చేయబడ్డాయి మరియు క్రమబద్ధమైన హోమోలజీని BLAST అధ్యయనం చేసింది మరియు Genebank లేదా NCBI సాఫ్ట్‌వేర్ యొక్క డేటాబేస్‌లకు వ్యతిరేకంగా శోధించింది. DNA సీక్వెన్స్ హోమోలజీ జన్యు డేటా బ్యాంక్‌లో P. ఎక్స్‌పాన్సమ్, P. డిజిటటమ్ మరియు P. బయోర్జియానం తెలిసిన DNA సీక్వెన్స్‌లతో 98% కంటే ఎక్కువ హోమోలజీని కలిగి ఉంటుందని DNA సీక్వెన్స్ హోమోలజీ చూపించింది. ఈ ఫంగల్ ఐసోలేట్లలో P. biourgieanum సోకిన సిట్రస్ నుండి వేరుచేయబడిన మరొక కొత్తగా నివేదించబడిన జాతి, మరియు NCBI జీన్ బ్యాంక్ యాక్సెషన్ నంబర్ KT336317 కేటాయించబడింది.