జర్నల్ ఆఫ్ ఆక్వాకల్చర్ రీసెర్చ్ & డెవలప్‌మెంట్

నైరూప్య

Gene2Path: ఆర్థోలాజస్ జన్యువుల స్వయంచాలక శోధన ద్వారా చేపల జన్యు మార్గాలను అధ్యయనం చేయడానికి డేటా విశ్లేషణ సాధనం

నటాలియా బల్లెస్టెరోస్, నెస్టర్ అగ్యురే, జూలియో కోల్, సారా ఐ పెరెజ్-ప్రిటో మరియు సిల్వియా రోడ్రిగ్జ్ సెయింట్-జీన్

జీవరసాయన మరియు పరమాణు ప్రయోగాల నుండి చాలా జన్యు నియంత్రణ మార్గాల డేటా మానవుల నుండి లేదా సాధారణంగా ప్రయోగాత్మక జంతు నమూనాలుగా ఉపయోగించే జాతుల నుండి తీసుకోబడింది. దీని ప్రకారం, నిర్దిష్ట జన్యు గుర్తింపు కోడ్‌లు (IDలు) లేదా ప్రవేశ సంఖ్యలు (AN) ఆధారంగా ఈ డేటాను విశ్లేషించే సాఫ్ట్‌వేర్ ప్యాకేజీలు జన్యు స్థాయిలో తక్కువ లక్షణాన్ని కలిగి ఉన్న ఇతర జీవులకు వర్తింపజేయడం సులభం కాదు. ఇక్కడ, మేము Gene2Path ప్రోగ్రామ్‌ను అభివృద్ధి చేసాము, ఇది మైక్రోఅరే డేటాను స్వతంత్ర, జాతుల-నిర్దిష్ట మార్గంలో విశ్లేషించడానికి పాత్‌వే డేటాబేస్‌లను స్వయంచాలకంగా శోధిస్తుంది. జీబ్రాఫిష్ వంటి ఇతర ప్రసిద్ధ జీవ జాతుల కోసం నిర్వచించబడిన ఆర్థోలాజస్ మార్గాల కోసం శోధించడానికి రోగనిరోధక లక్ష్యంగా ఉన్న రెయిన్‌బో ట్రౌట్ మైక్రోఅరే నుండి పొందిన డేటాతో మేము పద్ధతిని వివరించాము, అయినప్పటికీ సాఫ్ట్‌వేర్ ఏదైనా ఇతర సందర్భం లేదా ఆసక్తి ఉన్న జాతులకు వర్తించవచ్చు. స్క్రిప్ట్‌లు మరియు ప్రోగ్రామ్ “GENE2PATH” వెబ్‌సైట్ http://gene2path.no-ip.org/cgi-bin/gene2path/index.cgiలో అందుబాటులో ఉన్నాయి మరియు ఉచితంగా ఉంటాయి. వినియోగదారు గైడ్ మరియు ఉదాహరణలు ప్యాకేజీతో అందించబడ్డాయి. Gene2Path సాఫ్ట్‌వేర్ NCBI డేటాబేస్‌ల యొక్క స్వయంచాలక శోధనను మరియు గ్రాఫిక్ నెట్‌వర్క్ వాతావరణం ఆధారంగా తిరిగి పొందిన డేటా యొక్క సూటిగా దృశ్యమానతను అనుమతిస్తుంది.