జర్నల్ ఆఫ్ కార్సినోజెనిసిస్ & మ్యూటాజెనిసిస్

నైరూప్య

పెద్దప్రేగు మల క్యాన్సర్ కణితి కణాల జన్యు వ్యక్తీకరణ మెటా-విశ్లేషణ ట్యూమరిజెనిసిస్‌తో అనుబంధంలో జన్యువులను వెల్లడిస్తుంది.

రుత్వి వాజ

నేపథ్యం: ప్రతి సంవత్సరం, 12 మిలియన్లకు పైగా ప్రజలు కొలొరెక్టల్ క్యాన్సర్ (CRC)తో బాధపడుతున్నారు మరియు 600,000 కంటే ఎక్కువ మంది ప్రజలు మరణిస్తారు, ఇది క్యాన్సర్ యొక్క రెండవ అత్యంత ప్రాణాంతక రూపంగా మారింది. ఈ పని CRC మరియు ఇతర గ్రంధి కణితి నమూనాలలో అవకలన జన్యు వ్యక్తీకరణను విశ్లేషిస్తుంది. CRC ట్యూమరిజెనిసిస్ అభివృద్ధికి దోహదపడే వ్యక్తీకరణ మార్పులను గుర్తించడానికి.

పద్ధతులు: ఈ పని నాలుగు CRC కణితి మరియు 10 ఇతర గ్రంధి కణితులను సూచించే 13 జన్యు సంతకాలను నిర్వచిస్తుంది, ఇవి మూలం ద్వారా పెద్దప్రేగులో ఉంటాయి. జీన్ సెట్ ఎన్‌రిచ్‌మెంట్ అనాలిసిస్ (GSEA) అనేది రెండు CRC సంతకాలను ఉపయోగించి GSEA-గుర్తించబడిన ప్రముఖ-అంచు జన్యువుల నుండి సానుకూల మరియు ప్రతికూల CRC జన్యు ప్యానెల్‌లను నిర్వచించడానికి ఉపయోగించబడుతుంది. GSEA అప్పుడు రెండు స్వతంత్ర CRC జన్యు సంతకాలలో CRC ప్యానెల్‌ల సుసంపన్నత మరియు ప్రముఖ-అంచు జన్యు సభ్యత్వాన్ని ధృవీకరించడానికి ఉపయోగించబడుతుంది. విశ్లేషణ తర్వాత నాలుగు వ్యక్తిగత మరియు 10 గ్రంధి కణితి సంతకాలకి విస్తరించబడుతుంది. CRC ట్యూమరిజెనిసిస్‌తో ఎక్కువగా అనుబంధించబడిన జన్యువులు సంతకాల అంతటా GSEA-గుర్తించిన లీడింగ్-ఎడ్జ్‌ల ఖండన సభ్యత్వం ద్వారా అంచనా వేయబడతాయి.

ఫలితాలు: CRC జన్యు గుర్తింపు సంతకాల మధ్య గణనీయమైన సుసంపన్నత గమనించబడుతుంది, దాని నుండి సానుకూల (55 జన్యువులు) మరియు ప్రతికూల (77 జన్యువులు) CRC ప్యానెల్‌లు నిర్వచించబడ్డాయి. CRC జన్యు ప్యానెల్‌లు మరియు ధృవీకరణ సంతకాల మధ్య యాదృచ్ఛికం కాని ముఖ్యమైన సుసంపన్నత గమనించబడింది, దీని నుండి 54 కంటే ఎక్కువ మరియు 72 తక్కువ-వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు ప్రముఖ అంచులలో భాగస్వామ్యం చేయబడతాయి. ఇతర గ్రంధి కణితి నమూనాలను వ్యక్తిగతంగా మరియు CRCతో కలిపి పరిగణనలోకి తీసుకుంటే, ఈ సంతకాలలో గణనీయమైన యాదృచ్ఛికం కాని సుసంపన్నత గమనించవచ్చు. CRC ప్యానెల్ నుండి (SLC25A32, SLC22A3, SLC25A20, SLC36A1, SLC26A3, SLC9A2, SLC4A4 మరియు SLC26A2) వంటి ఎనిమిది ద్రావణ వాహక కుటుంబ జన్యువులు పెద్దప్రేగు రకంతో సంబంధం లేకుండా అన్ని జన్యు సంతకాలలో సాధారణంగా భాగస్వామ్యం చేయబడ్డాయి.

ముగింపు: ఈ మెటా-విశ్లేషణ CRC ట్యూమరిజెనిసిస్ ప్రక్రియతో అనుబంధించబడిన జన్యు వ్యక్తీకరణ మార్పులను గుర్తిస్తుంది. ఈ మార్పులు CRC రోగులకు అందుబాటులో ఉన్న చికిత్సా చికిత్సలను అభివృద్ధి చేయడానికి దోహదం చేస్తాయి.