జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

ఎపిజెనెటిక్స్ ఎవల్యూషన్ అండ్ రీప్లేస్‌మెంట్ హిస్టోన్స్: డ్రోసోఫిలా H2AvD వద్ద పరిణామాత్మక మార్పులు

Yoshinori Matsuo

హిస్టోన్‌లను ఎన్‌కోడ్ చేసే డ్రోసోఫిలా H2A మరియు H2AvD జన్యువులలోని పరిణామాత్మక మార్పులు 12 డ్రోసోఫిలా sp సీక్వెన్స్‌లను ఉపయోగించి విశ్లేషించబడ్డాయి. హిస్టోన్ రీప్లేస్‌మెంట్ మరియు ఎపిజెనెటిక్స్ యొక్క పరిణామాన్ని అర్థం చేసుకోవడం కోసం. బాల్ జన్యువు, హిస్టోన్ థ్రెయోనిన్ కినేస్ కోసం కోడింగ్ చేయబడింది, ఇది ఏడు డ్రోసోఫిలా spలో H2AvD జన్యువుతో తల నుండి తలపై ఉంది. H2AvD జన్యువు యొక్క ఎగువ ప్రాంతంలో కూడా బలంగా సంరక్షించబడిన DNA క్రమం కనుగొనబడింది; ఈ క్రమం చాలావరకు ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ సిగ్నల్, ఎందుకంటే ఈ క్రమం నాలుగు ఇతర డ్రోసోఫిలా spలో కూడా భద్రపరచబడింది. అది అప్‌స్ట్రీమ్ బాల్ జన్యువును కలిగి లేదు. SPARC జన్యువు, కాల్షియం-బైండింగ్ డొమైన్ కోసం కోడింగ్, 11 డ్రోసోఫిలా spలో H2AvD జన్యువు దిగువ ప్రాంతంలో తోక నుండి తోక వరకు ఉంది. చదువుకున్నాడు. మొదటి ఇంట్రాన్‌లోని స్ప్లికింగ్ సైట్‌లో H2AvD జన్యు ప్రాంతంలో మధ్యస్తంగా సంరక్షించబడిన DNA క్రమం కనుగొనబడింది. 17 అమైనో ఆమ్లాలలో 11 కోసం H2A మరియు H2AvD జన్యువులకు వేర్వేరు కోడాన్ ఉపయోగాలు కనుగొనబడ్డాయి మరియు అమైనో ఆమ్లాల కోసం రీప్లేస్‌మెంట్ హిస్టోన్‌ల (H2AvD, H4r, H3.3A మరియు H3.3B) కోడాన్ వినియోగాలు కనుగొనబడ్డాయి. H2A జన్యువులోని అనేక హిస్టోన్ సవరణ సైట్‌లలో కోడాన్ వినియోగం చాలా భిన్నంగా ఉంది. ఈ ఫలితాలు H3.3 మరియు H4r జన్యువుల వలె కాకుండా, పోస్ట్-ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ నియంత్రణ మాత్రమే కాకుండా, H2AvD జన్యువులో ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ నియంత్రణ కూడా పాత్ర పోషిస్తుందని సూచించాయి. స్ప్లికింగ్ మరియు ట్రాన్స్‌లేషన్ వంటి పోస్ట్-ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ నియంత్రణలతో పాటు, హిస్టోన్ రీప్లేస్‌మెంట్ మరియు ఎపిజెనెటిక్ సిస్టమ్‌ల పరిణామ సమయంలో ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ కోసం నియంత్రణ వ్యవస్థ అభివృద్ధి జరిగి ఉండాలి.