బయోమోలిక్యులర్ రీసెర్చ్ & థెరప్యూటిక్స్ జర్నల్

నైరూప్య

ట్రిపనోసోమా బ్రూసీకి కారణమయ్యే హ్యూమన్ స్లీపింగ్ సిక్‌నెస్ కోసం ఆర్నిథైన్ డెకార్బాక్సిలేస్ ఎంజైమ్‌కు వ్యతిరేకంగా అభ్యర్థి నిరోధక లిగాండ్‌ల ఇన్-సిలికో గుర్తింపు

హుక్కేరి S మరియు అలిన్నే బాటిస్టా అంబ్రోసియో

ఆర్నిథైన్ డెకార్బాక్సిలేస్ (ODC) ఆర్నిథైన్ యొక్క డీకార్బాక్సిలేషన్‌ను పుట్రెస్సిన్‌కు ఉత్ప్రేరకపరుస్తుంది. ఇది పాలిమైన్‌ల బయోసింథసిస్‌లో కీలకమైన దశ అని అంటారు. సూక్ష్మజీవుల కణాల పెరుగుదల మరియు విస్తరణకు ఈ పాలిమైన్‌లు అవసరం. అందువల్ల, ఆఫ్రికన్ స్లీపింగ్ సిక్‌నెస్ వ్యాధిని కలిగించే ప్రోటోజోవాన్ పరాన్నజీవి ట్రిపనోసోమా బ్రూసీకి చికిత్స చేయడానికి ODC ఎంజైమ్ ఉత్తమ లక్ష్యం. ODC అనేది 5'-పైరిడాక్సల్ ఫాస్ఫేట్ (PLP) ఆధారితం, డైమర్ ఇంటర్‌ఫేస్‌లో రెండు ఒకేలాంటి క్రియాశీల సైట్‌లతో ఒక ఆబ్లిగేట్ హోమోడైమర్ ఎంజైమ్, ఇందులో ఒక సబ్‌యూనిట్ నుండి బీటా లేదా ఆల్ఫా బారెల్ డొమైన్ మరియు మరొక సబ్‌యూనిట్ నుండి బీటా-షీట్ డొమైన్ ఉంటాయి. ఉత్ప్రేరక అవశేషాలు రెండు మోనోమర్‌ల నుండి క్రియాశీల సైట్‌కు దోహదం చేస్తాయి. వైల్డ్ T. బ్రూసీలో ODCపై ఎక్స్-రే క్రిస్టల్లాగ్రఫీ అధ్యయనం లిగాండ్ బైండింగ్‌పై రెండు నిర్మాణాత్మక మార్పులను వెల్లడించింది; ఒక అమైనో యాసిడ్ అవశేషాలు ప్రత్యేకంగా Lys-69 పుట్రెస్సిన్ ద్వారా స్థానభ్రంశం చెంది కొత్త పరస్పర చర్యను ఏర్పరుస్తుంది మరియు Cys-360 యొక్క సైడ్ చెయిన్ సక్రియ సైట్‌కి కదులుతుంది. Cys అవశేషాలను అలా లేదా సెర్ అమినో యాసిడ్‌గా మార్చడం వలన డీకార్బాక్సిలేషన్ ప్రతిచర్య యొక్క Kcat శక్తిని బాగా తగ్గిస్తుంది. ఆసక్తికరంగా, లిగాండ్ ZINC01703953 ప్రస్తుత అధ్యయనంలో ఆటోడాక్ సూట్‌తో వర్చువల్ స్క్రీనింగ్ (VS) ఆధారంగా పరీక్షించబడిన 35 లిగాండ్లలో -8.28 డాక్డ్ స్కోర్‌తో ODC ప్రోటీన్, Lys-69 ఫంక్షనల్ అమైనో యాసిడ్‌తో పరస్పర చర్యను చూపింది. మరొకటి, టాప్ స్కోరింగ్ (-9.69) లిగాండ్, ZINC67855534 మా ప్రస్తుత VS ప్రయోగం నుండి ODC ఎంజైమ్ యొక్క క్రియాశీల సైట్ నిర్మాణంలో పాల్గొన్న అమైనో ఆమ్ల అవశేషాలతో సంకర్షణ చెందుతుంది. అందువల్ల, లిగాండ్‌లు ZINC01703953 మరియు ZINC67855534 తదుపరి ఇన్-విట్రో ప్రయోగాత్మక ధృవీకరణలపై T. బ్రూసీకి వ్యతిరేకంగా సంభావ్య అభ్యర్థులుగా పరిగణించవచ్చు.