జర్నల్ ఆఫ్ బ్లడ్ డిజార్డర్స్ & ట్రాన్స్‌ఫ్యూజన్

నైరూప్య

మైకోబాక్టీరియం క్షయవ్యాధికి (Mtb) వ్యతిరేకంగా సంభావ్య ఔషధ పరిటాప్రెవిర్ యొక్క డాకింగ్ మాలిక్యులర్ విశ్లేషణ

ఇవాన్ వీటో ఫెరారీ*, పాలో ప్యాట్రిజియో

మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ (Mtb) అనేది క్షయవ్యాధికి కారణమయ్యే ఏజెంట్, ఇది ఏటా 1.8 మిలియన్లను చంపుతుంది. ఇది ఒక అంటు వ్యాధి సాధారణంగా ఊపిరితిత్తులను ప్రభావితం చేస్తుంది, కానీ శరీరంలోని ఇతర భాగాలను కూడా ప్రభావితం చేస్తుంది. Mtb RNA పాలిమరేస్ (RNAP) అనేది మొదటి-లైన్ యాంటీ-ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ డ్రగ్ రిఫాంపిన్ (Rif) లక్ష్యం. Pyrx మరియు AM డాక్ సాఫ్ట్‌వేర్‌తో అంచనా వేసిన ఆటో డాక్ వినా మరియు ఆటో డాక్ 4 (లేదా MGL టూల్)ని ఉపయోగించి సిలికో విధానంలో తీవ్రమైన అంటు వ్యాధికి వ్యతిరేకంగా పరిటాప్రెవిర్ అనే సంభావ్య డ్రగ్‌ను మేము మొదటిసారిగా నివేదించాము : బైండింగ్ అఫినిటీ (బైండింగ్ అఫినిటీ) kcal/mol), అంచనా వేయబడిన Ki (nM యూనిట్లలో) మరియు లిగాండ్ ఎఫిషియెన్సీ (LE in kcal/mol). ప్రోటీన్ యొక్క లిగాండ్ బైండింగ్ సైట్ పాకెట్ (ID PDB 5UHB చైన్ C, DNA- దర్శకత్వం వహించిన RNA పాలిమరేస్ సబ్యూనిట్ బీటా)లో Pyrx (కంప్యూటేషనల్ డ్రగ్ డిస్కవరీ కోసం ఒక వర్చువల్ స్క్రీనింగ్ సాఫ్ట్‌వేర్)తో ప్రాసెస్ చేయబడిన 1000 ఔషధాల ఎంపిక విశ్లేషణ తర్వాత, మేము అధిక స్థాయిని గమనించాము. Paritaprevir పైన పేర్కొన్న ఈ 3 పారామీటర్ల విలువలు, ఇది అద్భుతమైన అభ్యర్థి అని నిర్ధారించింది ఈ రకమైన సంక్రమణకు మందు. నిజానికి, ఆటో డాక్ వినా మరియు ఆటో డాక్ 4 (లేదా ఆటో డాక్ 4.2) ఫలితాల నుండి, లామార్కియన్ జెనెటిక్ అల్గారిథమ్, LGA, ట్రఫ్ AM డాక్ సాఫ్ట్‌వేర్‌తో అమలు చేయబడింది, ఈ ఓరల్ డ్రగ్, 2014లో FDAచే ఆమోదించబడింది, ఆటో డాక్ వినా మరియు ఆటో రెండూ డాక్ వినా 4 అద్భుతమైన బైండింగ్ అనుబంధ విలువను కలిగి ఉంది, ca. -10.00 kcal/ mol, a Ki విలువ 40 nM మరియు లిగాండ్ సామర్థ్యం ca-0.15 kcal/mol. ఈ ఫలితాలు పైన పేర్కొన్న ప్రొటీన్‌లో స్ఫటికీకరించబడిన డ్రగ్‌తో పోల్చవచ్చు, ప్రస్తుతం TBCకి వ్యతిరేకంగా ఉపయోగిస్తున్నారు.