జర్నల్ ఆఫ్ స్టెమ్ సెల్ రీసెర్చ్ & థెరపీ

నైరూప్య

డిఫరెన్షియల్ miRNA వ్యక్తీకరణ మానవ కొలొరెక్టల్ క్యాన్సర్‌లో బహుళ క్యాన్సర్ స్టెమ్ సెల్ సబ్‌పోపులేషన్‌ల ఆవిర్భావానికి దోహదం చేస్తుంది

విక్టోరియా A. స్టార్క్, కరోలిన్ OB ఫేసీ, లిన్ M. ఒప్డెనాకర్, జెరెమీ Z. ఫీల్డ్స్, బ్రూస్ M. బోమన్1

క్యాన్సర్ థెరప్యూటిక్స్‌లో సమర్థత లేకపోవడానికి ఒక కారణం కణితి వైవిధ్యత. బహుళ క్యాన్సర్ స్టెమ్ సెల్ (CSC) సబ్‌పోపులేషన్‌ల ఆవిర్భావం కారణంగా కణితి వైవిధ్యత ఉత్పన్నమవుతుందని మేము ఊహిస్తున్నాము ఎందుకంటే miRNA లు CSC లలో స్టెమ్ సెల్ జన్యువుల వ్యక్తీకరణను నియంత్రిస్తాయి. మా లక్ష్యం: i) మానవ CRC సెల్ జనాభాలో బహుళ CSC ఉప-జనాభా ఉందా మరియు ii) miRNAలు వేర్వేరు CSC ఉప-జనాభాలో విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడతాయి. HT29 సెల్ లైన్‌లో కనీసం నాలుగు వేర్వేరు CSC పాపులేషన్‌లు (ALDH1, CD166, LGR5 మరియు LRIG1) ఉన్నాయని మేము కనుగొన్నాము. CSC ఉప-జనాభాను బహుళ స్టెమ్ సెల్ మార్కర్‌ల కోసం కో-స్టెయినింగ్ ఉపయోగించి లెక్కించారు, FACS ఉపయోగించి వేరుచేయబడింది మరియు నానోస్ట్రింగ్ miRNA ప్రొఫైలింగ్ ద్వారా విశ్లేషించబడింది. ప్రతి CSC ఉప జనాభాలోని miRNA వ్యక్తీకరణ నమూనా ఇతర CSC ఉప జనాభాలో miRNA వ్యక్తీకరణ నమూనాలకు సంబంధించి విశ్లేషించబడింది. ప్రతి CSC సబ్‌పోపులేషన్‌లోని అప్-రెగ్యులేటెడ్ miRNAలచే లక్ష్యంగా అంచనా వేయబడిన మెసెంజర్ RNAలు: 1) బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణలను ఉపయోగించి గుర్తించబడ్డాయి మరియు 2) డేవిడ్ ఫంక్షనల్ ఉల్లేఖన విశ్లేషణలను ఉపయోగించి వాటి అంచనా వేసిన ఫంక్షన్‌ల ప్రకారం వర్గీకరించబడ్డాయి. మేము ప్రతి CSC సబ్‌పోపులేషన్‌లో ప్రత్యేకమైన miRNA సంతకంతో బహుళ CSC సబ్‌పోపులేషన్‌లను కనుగొన్నాము. ముఖ్యంగా, ఒక CSC సబ్‌పోపులేషన్‌లో వ్యక్తీకరించబడిన miRNAలు ఇతర CSC ఉప-జనాభాను స్థాపించే CSC జన్యువులు మరియు మార్గాలను లక్ష్యంగా చేసుకుని మరియు తగ్గించగలవని అంచనా వేయబడింది. అంతేకాకుండా, వివిధ CSC ఉప-జనాభాలో miRNAలచే లక్ష్యంగా అంచనా వేయబడిన mRNAలు వేర్వేరు సెల్యులార్ ఫంక్షనల్ వర్గీకరణలను కలిగి ఉంటాయి. ఇతర CSC ఉప-జనాభాలో వ్యక్తీకరించబడిన CSC జన్యువులను లక్ష్యంగా చేసుకోవచ్చని అంచనా వేయబడిన వివిధ CSC ఉప-జనాభా miRNAలను వ్యక్తపరుస్తుంది, ఇది బహుళ CSC ఉప-జనాభా, కణితి వైవిధ్యత మరియు క్యాన్సర్ చికిత్స నిరోధకత యొక్క సహ-ఉనికిని వివరించే యంత్రాంగాన్ని అందిస్తుంది.