జర్నల్ ఆఫ్ స్టెమ్ సెల్ రీసెర్చ్ & థెరపీ

నైరూప్య

పెప్టైడ్ బైండింగ్ ప్రత్యేకతలు మరియు T-సెల్ వైవిధ్యంపై 156వ స్థానంలో ఉన్న HLA-B*44 అల్లెలిక్ మిస్‌మాచెస్ యొక్క అవకలన ప్రభావం

సౌమ్య బద్రీనాథ్, ట్రెవర్ హ్యూటన్, హేకే కుంజే-షూమేకర్, హోల్గర్ ఆండ్రియాస్ ఎల్స్నర్, రైనర్ బ్లాస్జిక్ మరియు క్రిస్టినా బాడే డోడింగ్

మేము రోగులు మరియు దాతలతో సరిపోలడం లేదు మరియు ఇప్పటికీ విజయవంతమైన క్లినికల్ ఫలితాలను ఎలా పొందగలము అనే పరమాణు అవగాహన సంబంధం లేని ఎముక-మజ్జ మార్పిడి యొక్క భవిష్యత్తుకు మార్గనిర్దేశం చేయడంలో సహాయపడుతుంది. B*44 వేరియంట్‌ల ఆల్ఫా 2 హెలిక్స్‌లో 156వ స్థానంలో ఉన్న ఒకే అమైనో ఆమ్లం అసమతుల్యత రోగనిరోధక ఎపిసోడ్‌లకు కారణమవుతుందని వివరించబడింది. B44/156 వేరియంట్‌ల మధ్య పర్మిసివిటీ పరిమాణం పెప్టైడ్ ప్రెజెంటేషన్ నుండి పెప్టైడ్ లోడింగ్ కాంప్లెక్స్ (B*44:28) నుండి స్వతంత్రంగా ఉండి క్లినికల్ ఎపిసోడ్‌లను ప్రభావితం చేస్తుంది (B*44:02 vs. B*44:03). అవశేష 156 వద్ద B*44:35లో సంభవించే Asp>Glu యొక్క ఒకే మార్పిడి విట్రోలో రోగనిరోధక ప్రతిస్పందనను బలవంతం చేస్తుందా అని మేము ఇక్కడ పరిశోధించాము. దాత కణాలలో సింగిల్ మెమ్బ్రేన్-బౌండ్ అలోజెనిక్ HLA క్లాస్ I మాలిక్యూల్‌ని రీకాంబినెంట్ కో-ఎక్స్‌ప్రెషన్ ద్వారా మేము ఇన్ విట్రో సిస్టమ్‌ను అభివృద్ధి చేసాము మరియు ఈ కణాలను ఆటోలోగస్ T-కణాలతో సహ-ఇంక్యుబేట్ చేసాము. ఈ వ్యూహం సింగిల్ హెచ్‌ఎల్‌ఏ క్లాస్ I అసమతుల్యత అధ్యయనాన్ని అనుమతిస్తుంది మరియు మైనర్ యాంటిజెన్‌ల ప్రభావాన్ని మినహాయిస్తుంది. ఈ T-కణాలు సరిపోలని B*44 ఉప రకాలు మరియు వాటి మైక్రోపాలిమార్ఫిజం మధ్య భేదాత్మకంగా వివక్ష చూపగలవని మేము కనుగొన్నాము. నిర్దిష్ట pHLA ప్రకృతి దృశ్యాలు అలోరియాక్టివ్ రోగనిరోధక ప్రతిస్పందనను ఎలా రూపొందిస్తాయో అర్థం చేసుకోవడానికి, మేము LC-ESI-MS/MS సాంకేతికతను ఉపయోగించి B*44/156 సబ్టైప్‌ల నుండి పొందిన వ్యక్తిగత పెప్టైడ్‌లను క్రమం చేసాము. పెప్టైడ్ డేటా ఆధారంగా మేము B*44:35 వేరియంట్ యొక్క నిర్మాణాన్ని రూపొందించాము మరియు భారీ గొలుసు యొక్క నిర్మాణాత్మక మానిప్యులేషన్ ద్వారా సరిపోలని B*44 సబ్టైప్‌ల యొక్క ఊహించని రోగనిరోధక ప్రతిచర్యను వివరించవచ్చు. కీ యుగ్మ వికల్పాల కోసం పెప్టైడ్-బైండింగ్ ప్రొఫైల్‌ల యొక్క ఖచ్చితమైన క్యారెక్టరైజేషన్, అలాగే T-సెల్ ప్రతిస్పందనల మూల్యాంకనం మరియు వన్-అల్లెల్ అసమతుల్యత సందర్భంలో నిర్మాణ విశ్లేషణ ఎముకమజ్జ మార్పిడిలో కొత్త శకానికి తలుపులు తెరుస్తుంది.