జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

Xylella fastidiosa subsp యొక్క వేగవంతమైన గుర్తింపు మరియు భేదం కోసం క్వాంటిటేటివ్ రియల్-టైమ్ పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ ప్రోటోకాల్‌ల అభివృద్ధి. ఫాస్టిడియోసా మరియు జిలేల్లా ఫాస్టిడియోసా సబ్‌స్పి. మల్టీప్లెక్స్

బ్రిటనీ పియర్స్, లిసా మొరానో మరియు బ్లేక్ బెక్స్టైన్

Xylella fastidiosa అనేది గ్రామ్-నెగటివ్, జిలేమ్-పరిమిత, మొక్కల వ్యాధికారక బాక్టీరియం, ఇది గ్లాసీ-వింగ్డ్ షార్ప్‌షూటర్ (హోమలోడిస్కా విట్రిపెన్నిస్) ద్వారా హోస్ట్‌ల మధ్య వ్యాపిస్తుంది. X. ఫాస్టిడియోసా యొక్క బహుళ ఉపజాతులు ఏర్పడతాయి, ఇది హోస్ట్ నిర్దిష్టత యొక్క కొంత స్థాయిని ప్రదర్శిస్తుంది. X. ఫాస్టిడియోసా సబ్‌స్పి. ఫాస్టిడియోసా అనేది ద్రాక్షపండు యొక్క పియర్స్ వ్యాధికి కారణ కారకం. X. ఫాస్టిడియోసా సబ్‌స్పి. మల్టీప్లెక్స్ మరియు X. ఫాస్టిడియోసా సబ్‌స్పి. శాండీ సాధారణంగా ఉత్తర అమెరికాలో కనిపిస్తాయి కానీ పియర్స్ వ్యాధికి కారణం కాదు. X. ఫాస్టిడియోసా ఉనికిని నిర్ధారించడానికి వేగవంతమైన రోగనిర్ధారణ మరియు ఈ ఉపజాతుల యొక్క భేదం పియర్స్ వ్యాధి యొక్క సమర్థవంతమైన నిర్వహణ మరియు నివారణకు అవసరం. ఈ అధ్యయనంలో, క్వాంటిటేటివ్ రియల్-టైమ్ పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ ఉపయోగించి X.fastidiosa ఉపజాతులను వేరు చేయడానికి మూడు పద్ధతులు పోల్చబడ్డాయి. SYBR ® గ్రీన్, ఎవా గ్రీన్ ® , మరియు తకారా SYBR గ్రీన్ ® పాక్షిక గైరేస్‌బి యాంప్లికాన్‌ల మెల్ట్ కర్వ్ విశ్లేషణ, జోట్1 జీన్ యాంప్లికాన్‌లు మరియు ఐదు టన్నుల బి యాంప్లికాన్‌లు స్థిరత్వం మరియు నాణ్యత కోసం మూల్యాంకనం చేయబడ్డాయి. TaqMan ® మరియు మాలిక్యులర్ బెకన్ ® హైబ్రిడైజేషన్ ప్రోబ్స్ ఆధారంగా డయాగ్నస్టిక్ ప్రోటోకాల్‌లు X. ఫాస్టిడియోసా సబ్‌స్పిపై ఉంచబడిన ప్రాధాన్యతతో అభివృద్ధి చేయబడ్డాయి. zot1 జన్యువులో మల్టీప్లెక్స్ చొప్పించడం. SYBR ® గ్రీన్ మరియు TaqMan ® ఆధారిత డయాగ్నస్టిక్ ప్రోటోకాల్‌లు X. ఫాస్టిడియోసా ఉపజాతుల యొక్క ఖచ్చితమైన మరియు స్థిరమైన భేదం కోసం అవసరమైన రిజల్యూషన్‌ను అందించలేదని మేము కనుగొన్నాము. మాలిక్యులర్ బెకన్ ® ప్రోబ్‌ని ఉపయోగించి మేము అభివృద్ధి చేసిన డయాగ్నస్టిక్ ప్రోటోకాల్‌లు X. ఫాస్టిడియోసా ఉపజాతుల యొక్క అత్యంత నిర్దిష్టమైన మరియు విశ్వసనీయమైన భేదాన్ని, ద్రావణంలో ఉపజాతులు కలిపిన సందర్భాల్లో కూడా అనుమతిస్తాయి. ఈ కొత్త పద్ధతులు మరింత విశ్వసనీయమైన ప్రోటోకాల్‌ను అందిస్తాయి, దీని ద్వారా X. ఫాస్టిడియోసా యొక్క ఉపజాతులు ప్రయోగశాల అధ్యయనం మరియు నమూనా విశ్లేషణల ప్రయోజనాల కోసం వేగంగా గుర్తించబడతాయి.