జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

ఫిలిప్పీన్స్‌లో టొమాటో ఆకు కర్ల్‌కు కారణమయ్యే బెగోమోవైరస్ జాతుల నిర్దిష్ట గుర్తింపు కోసం పరమాణు ఆధారిత పద్ధతి అభివృద్ధి

జెరెమీ రాయ్ అగస్టస్ I గోమెజ్*

టొమాటో దాని ఆర్థిక మరియు పోషక విలువల కారణంగా అత్యంత ముఖ్యమైన కూరగాయల పంటలలో ఒకటి, అయితే బెగోమోవైరస్ వల్ల కలిగే వ్యాధి కారణంగా , టమోటా ఉత్పత్తి సంవత్సరాలుగా క్షీణించింది. టొమాటో పసుపు ఆకు కర్ల్ లేదా టొమాటో లీఫ్ కర్ల్‌కు కారణమయ్యే బెగోమోవైరస్‌లు ప్రపంచంలోని అనేక ఉష్ణమండల మరియు ఉపఉష్ణమండల ప్రాంతాల్లో టమోటా ఉత్పత్తిని ప్రభావితం చేస్తాయి. ఈ మొక్కల వైరస్‌లపై పరిమిత గుర్తింపు వాటిని గుర్తించడం మరియు నియంత్రించడం చాలా కష్టతరం చేసింది. ToLCPV మరియు ToLCCeV యొక్క నిర్దిష్ట గుర్తింపు కోసం పరమాణు ఆధారిత పద్ధతిని అభివృద్ధి చేయడం ఈ అధ్యయనం లక్ష్యం. దీని ద్వారా ఇది జరిగింది: 1) బహుళ శ్రేణి అమరికను ఉపయోగించి ప్రచురించిన ప్రైమర్‌లు నిర్దిష్ట బెగోమోవైరస్ జాతికి ఎనియల్ చేయవచ్చో లేదో ధృవీకరించడం, 2) ToLCPV లేదా ToLCCeV యొక్క నిర్దిష్ట గుర్తింపు కోసం ప్రైమర్‌లను రూపొందించడం మరియు PCR ద్వారా ఆప్టిమైజ్ చేయడం, 3) నిర్దిష్ట గుర్తింపు కోసం రూపొందించిన ప్రైమర్‌ను ధృవీకరించడం ఫీల్డ్ సేకరించిన నమూనాలను ఉపయోగించి ToLCPV మరియు ToLCCeV యొక్క, 4) పూర్తి నిడివిని ఉపయోగించి RFLP నమూనాను గుర్తించడానికి సిలికోలో జన్యు DNA . ప్రచురించబడిన ప్రైమర్‌లు ToLCPV జాతులు మరియు ToLCCeV, ToLCMiV జాతులకు ఎనియల్ చేయగలిగాయి మరియు అందువల్ల ఈ ప్రైమర్‌లు వాటి నిర్దిష్టతను గుర్తించడానికి వాస్తవ ప్రయోగంలో ధృవీకరించబడాలి. ToLCPV19 మరియు ToLCCeV19 ప్రైమర్‌లు వరుసగా ToLCPV మరియు ToLCCeV జాతులను ప్రత్యేకంగా గుర్తించేందుకు రూపొందించబడ్డాయి మరియు PCR వేరొక ఎనియలింగ్ ఉష్ణోగ్రతలకు ఆప్టిమైజ్ చేయబడింది: 53℃, 55℃ మరియు 57℃. ToLCPV సోకిన టొమాటో నమూనాలపై ~ 200 bp యాంప్లికాన్‌లు గమనించబడ్డాయి మరియు ToLCPV19 మరియు ToLCCeV19 ప్రైమర్‌లను ఉపయోగిస్తున్నప్పుడు ToLCCeV సోకిన టమోటా నమూనాలు కూడా గమనించబడ్డాయి. అలాగే, వివిధ ఎనియలింగ్ ఉష్ణోగ్రతల వద్ద బ్యాండ్ పరిమాణం మరియు బ్యాండ్‌ల తీవ్రతలో తేడా లేదు. డిజైన్ చేయబడిన ప్రైమర్‌ల యొక్క ధృవీకరణ జరిగింది కానీ కొన్ని ఎంపిక చేసిన టొమాటో శాంపిల్స్‌కు మాత్రమే చేయబడుతుంది మరియు ఆ విధంగా డిజైన్ చేయబడిన ప్రైమర్‌ల యొక్క విశిష్టతను గుర్తించడానికి తదుపరి ధ్రువీకరణ చేయాలి. ప్రతి బెగోమోవైరస్ జాతికి వేర్వేరు సంఖ్యలో బ్యాండ్‌లను ఉత్పత్తి చేయడం వలన పరిమితి ఎంజైమ్ EcoRI ToLCPV, ToLCCeV మరియు ToLCMiVలను వేరు చేయగలదని RFLP విశ్లేషణ చూపించింది .