జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

ఫ్యూసేరియం ఆక్సిస్పోరమ్ ఎఫ్ యొక్క గుర్తింపు. sp. లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ (LAMP)ని ఉపయోగించి ఆయిల్ పామ్ యొక్క ఫ్యూసేరియం విల్ట్‌కు కారణమయ్యే elaeidis

క్వాసీ అడుసే-ఫోసు మరియు మాథ్యూ డికిన్సన్

ఫ్యూసేరియం ఆక్సిస్పోరమ్ ఎఫ్. sp. elaeidis (FOE) ఆయిల్ పామ్‌లో ఫ్యూసేరియం విల్ట్ వ్యాధికి కారణమయ్యే వ్యాధికారక పాలీమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (PCR)ని ఉపయోగించి గుర్తించవచ్చు కానీ చాలా సమయం తీసుకుంటుంది. లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ (LAMP) ఫ్యూసేరియం ఆక్సిస్పోరమ్ ఎఫ్‌ను వేగంగా గుర్తించడానికి ఉపయోగించబడింది. sp. ఆయిల్ పామ్ మొలకలలో elaeidis (FOE). రోగలక్షణ ఆయిల్ పామ్ చెట్ల నుండి సేకరించిన ఎనిమిది అదనపు ఫ్యూసేరియం ఆక్సిస్పోరమ్ ఐసోలేట్‌లు (అనగా, వాటి వ్యాధికారకత నిర్ధారించబడనందున FOE ఊహించబడింది) మరియు పరిశోధన యొక్క పరిధిని విస్తృతం చేయడానికి వరుసగా రోగలక్షణ పరిపక్వ ఆయిల్ పామ్ చెట్లు మరియు టొమాటో నుండి మరో ఐదు నాన్-FOE ఐసోలేట్‌లు నమూనా చేయబడ్డాయి. FOE, ఊహించిన-FOE మరియు నాన్-FOE యొక్క గుర్తింపులు సీక్వెన్సింగ్ ద్వారా స్థాపించబడ్డాయి. FOE లేదా ఊహించిన-FOEని గుర్తించడం కోసం రూపొందించిన LAMP ప్రైమర్‌లు Xylem (SIX8) మరియు P-450 సైటోక్రోమ్‌లో పాక్షిక సీక్వెన్స్‌ల ఆధారంగా రూపొందించబడ్డాయి. SIX8 మరియు P-450 సైటోక్రోమ్ ప్రైమర్‌ల కోసం తొలి గుర్తింపు సమయం వరుసగా 4:00 నిమిషాలు మరియు 6:45 నిమిషాలు, రెండూ 26:30 నిమిషాలకు గుర్తించడానికి ఆలస్యమైన సమయాన్ని నమోదు చేస్తాయి. SIX8 మరియు P-450 సైటోక్రోమ్ రెండింటికీ నిర్దిష్టత స్థాయిని అంచనా వేయడానికి అన్నేలింగ్ డెరివేటివ్ కర్వ్‌లు ఉపయోగించబడ్డాయి, అయితే LAMP ప్రైమర్‌లు ఏవీ FOE, ఊహించిన-FOE మరియు నాన్-FOE మధ్య తేడాను గుర్తించలేకపోయాయి.