జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

రివర్స్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ ద్వారా బంగాళాదుంప లీఫ్‌రోల్ వైరస్ యొక్క కోట్ ప్రోటీన్ జన్యువును గుర్తించడం

మహ్మద్ అమీన్ అల్మాసి, హుస్సేన్ జాఫరీ, అబౌబకర్ మొరాది, నేడా జంద్, మెహదీ అఘపూర్ ఓజఘ్‌కండి మరియు సయీదే అఘై

లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ అస్సే అధిక నిర్దిష్టత మరియు సున్నితత్వంతో DNA/RNAని పెంచుతుంది. ఈ అధ్యయనంలో, మేము పొటాటో లీఫ్‌రోల్ వైరస్‌ని గుర్తించడం కోసం ఆప్టిమైజ్ చేసిన రివర్స్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్-LAMP పరీక్షను వివరిస్తాము. ముందుగా, 40 అనుమానాస్పద నమూనాలను కలిగి ఉన్న సేకరణలో వైరస్‌ను గుర్తించడానికి DAS-ELISA పరీక్ష జరిగింది. చివరగా, రెండు నమూనాలు సానుకూల నమూనాలుగా గుర్తించబడ్డాయి. అప్పుడు, సానుకూల నమూనాలు RT-PCR మరియు RT-LAMP పద్ధతుల ద్వారా ధృవీకరించబడ్డాయి. ఇంకా, RT-PCRతో పోలిస్తే RT-LAMP పరీక్ష 40 రెట్లు సున్నితంగా మరియు 4 రెట్లు వేగంగా ఉందని ఫలితాలు నిరూపించాయి. RT-LAMP పరీక్ష నీటి స్నానంలో ఏదైనా థర్మల్ సైక్లర్ యంత్రం లేదా అధునాతన ప్రయోగశాలల సౌకర్యం నుండి విముక్తి పొందింది. అంతేకాకుండా, RT-LAMP ప్రతిచర్యలో మెగ్నీషియం పైరోఫాస్ఫేట్ ద్వారా ఉత్పత్తి చేయబడిన టర్బిడిటీ ద్వారా సానుకూల నమూనాలు కనుగొనబడ్డాయి. ఆసక్తికరంగా,
ప్రతిచర్యలో కాల్షియం పైరోఫాస్ఫేట్‌ను సృష్టించే MgSO4 కి బదులుగా CaCl2ని ఉపయోగించడం వలన స్థిరత్వం మరియు టర్బిడిటీ ఏకాగ్రత రెండింటినీ గణనీయంగా పెంచుతుంది. పర్యవసానంగా, ఇది MgSO4కి ఆసక్తికరమైన ప్రత్యామ్నాయం కావచ్చు. మొత్తంమీద, కొత్తగా అభివృద్ధి చేయబడిన RT-LAMP పరీక్ష బంగాళాదుంప ఆకు వైరస్ మరియు ఇతర వైరల్ మొక్కల వ్యాధికారకాలను ముందస్తుగా గుర్తించడానికి సున్నితమైన, నిర్దిష్టమైన మరియు తక్కువ-ధర పద్ధతి.