ఫార్మాస్యూటికా అనలిటికా ఆక్టా

నైరూప్య

NMR మరియు మాలిక్యులర్ డైనమిక్స్ ఉపయోగించి ఫెరోమోనోట్రోపిన్ న్యూరోపెప్టైడ్‌పై కన్ఫర్మేషనల్ స్టడీ

దీప్ భట్టాచార్య, నితిన్ మిశ్రా, ఎవాన్స్ సి కౌటిన్హో, సుధా శ్రీవాస్తవ, రఘువీర్ ఆర్ఎస్ పిసుర్లెంకర్ మరియు ముస్తాక్ షేక్

ఫెరోమోనోట్రోపిక్ న్యూరోపెప్టైడ్, సూడలేటియా ఫెరోమోనోట్రోపిన్, Lys-Leu-Ser-Tyr-Asp-Asp-Lys-Val-Phe-Glu-Asn-Val-Glu-Phe-Thr-Lpro-A క్రమంతో 18 అమైనో ఆమ్లం పెప్టైడ్. ఇది బాంబిక్స్ యొక్క ఆడ చిమ్మటలలో విస్తృతంగా పంపిణీ చేయబడుతుంది మోరీ. ఈ పెప్టైడ్ నిర్మాణాత్మకంగా ల్యూకోపైరోకినిన్ అనే క్రిమి మయోట్రోపిక్ న్యూరోపెప్టైడ్‌కు సంబంధించినది, ఇది మెలనైజేషన్ మరియు ఎర్రటి రంగు హార్మోన్ (MRCH) కార్యకలాపాలకు బాధ్యత వహిస్తుంది. ఒక ద్రావకం వలె ఉపయోగించబడే నీటిలో కన్ఫర్మేషనల్ ప్రవర్తనను తెలుసుకోవడానికి ఒక సంయుక్త NMR మరియు మాలిక్యులర్ డైనమిక్స్ (MD) పద్ధతులు ఉపయోగించబడ్డాయి. 1D-NMR మరియు 2D-NMR (COSY, TOCSY మరియు ROESY) ప్రయోగాలను ఉపయోగించి నిర్మాణం పరిశోధించబడింది. GROMACS అనుకరణ ప్యాకేజీలోని NMR డేటా నుండి దూరం మరియు డైహెడ్రల్ నియంత్రణలను ఉపయోగించి నిర్బంధిత MD అనుకరణల ద్వారా ఆకృతి నిర్మించబడింది. పెప్టైడ్ ప్రధానంగా నీటిలో β-షీట్ నిర్మాణాన్ని అవలంబిస్తుంది.