బయోమోలిక్యులర్ రీసెర్చ్ & థెరప్యూటిక్స్ జర్నల్

నైరూప్య

[ 11 Ψ 12 (CN 4 )]ScyII మరియు [ 15 Ψ 16 (CN 4 )]ScyII– 2D NMR స్పెక్ట్రోస్కోపీ మరియు థియరిటికల్ మెథడ్స్ ద్వారా రెండు సైలియోరినిన్ II అనలాగ్‌ల యొక్క కన్ఫర్మేషనల్ స్టడీస్

Krzysztof Brzozowski, Emilia Sikorska, Hanna Miecznikowska, Katarzyna Konecko, Rafał Ślusarz, Jolanta Kumirska, Witold Mozga, Jacek Olczak, Janusz Zabrocki, Sylwia Romdow- Zbigniew Kaczyński

Scyliorhinin II [11Ψ12(CN4])]ScyII మరియు [15Ψ16(CN4)]ScyII యొక్క రెండు అనలాగ్‌ల యొక్క కన్ఫర్మేషనల్ విశ్లేషణ DMSO-d6లో ప్రదర్శించబడింది. 2D NMR పద్ధతులు మరియు నిరోధించబడిన పరమాణు డైనమిక్స్ వర్తింపజేయబడ్డాయి. మా మునుపటి అధ్యయనాలు Scyliorhinin II DMSO-d6 ద్రావణంలో మూడు సిస్ పెప్టైడ్ బంధాలను స్వీకరించినట్లు చూపించాయి. అంతేకాకుండా, దాని రెండు అనలాగ్‌లలో [Aib16] ScyII మరియు [Sar16]ScyII, మేము సిస్ పెప్టైడ్ బాండ్ జామెట్రీలను కూడా కనుగొన్నాము. పైన పరిగణలోకి తీసుకొని, మేము నిగ్రహించబడిన ScyII అనలాగ్‌ల యొక్క విస్తృతమైన ఆకృతీకరణ అధ్యయనాలను నిర్వహించాలని నిర్ణయించుకున్నాము. అలా చేయడానికి, మేము అధ్యయనం చేసిన పెప్టైడ్‌లలో దేనికైనా టెట్రాజోల్ సమూహాలను పరిచయం చేసాము. ఈ పెప్టైడ్‌లు Fmoc కెమిస్ట్రీని ఉపయోగించి ఘన-దశ పద్ధతి ద్వారా సంశ్లేషణ చేయబడ్డాయి. రెండు అనలాగ్‌ల విషయంలో, కింది స్పెక్ట్రా రికార్డ్ చేయబడింది: TOCSY, NOESY, ROESY, DQF-COSY మరియు ఉష్ణోగ్రతల సెట్. తుది నిర్మాణాలను పొందేందుకు, మేము XPLOR 3.11 ప్రోగ్రామ్‌లో అమలు చేసిన విధంగా CHARMM ఫోర్స్ ఫీల్డ్‌ని ఉపయోగించి నిర్వహించబడిన నియంత్రిత మాలిక్యులర్ డైనమిక్స్ అనుకరణలను ప్రదర్శించాము. మా లెక్కల ఫలితంగా ఒక్కొక్కటి 10 కన్ఫర్మేషన్‌ల రెండు బృందాలు వచ్చాయి. పొందిన నిర్మాణాలను పోల్చి చూస్తే, 1,5-ప్రత్యామ్నాయ టెట్రాజోల్ రింగ్ పరిచయం స్థానికంగా మరియు ప్రపంచవ్యాప్తంగా త్రిమితీయ నిర్మాణాన్ని ప్రభావితం చేస్తుందని మేము కనుగొన్నాము.