జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

హ్యూమన్ హెర్పెస్ వైరస్ యొక్క క్యాప్సిడ్ ప్రోటీన్ల కోసం దూరం మరియు పాత్ర ఆధారిత ఫైలోజెనెటిక్ చెట్టు యొక్క గణన విశ్లేషణ

విపన్ కుమార్ సోహ్‌పాల్, అపూర్బా డే మరియు అమర్‌పాల్ సింగ్

మాలిక్యులర్ ఫైలోజెనెటిక్ అనేది పరిణామ విశ్లేషణ యొక్క ప్రాథమిక అంశం మరియు దూరం & పాత్ర ఆధారిత పద్ధతులపై ఆధారపడి ఉంటుంది. ఈ పేపర్‌లో, ప్రత్యామ్నాయ నమూనాలు, ఫైలోజెనెటిక్ మోడల్‌తో సమగ్ర శోధన మరియు ME పద్ధతులను ఉపయోగించి ప్రోటీన్‌ల మధ్య సంబంధాన్ని విశ్లేషించడానికి మేము HHV యొక్క వైరల్ క్యాప్సిడ్ ప్రోటీన్‌లను పోల్చాము. NJ మరియు UPGMA చెట్లపై ఆకార పరామితితో పాయిజన్ కరెక్షన్ ప్రభావం కూడా విశ్లేషిస్తుంది. ఫైలోజెనెటిక్ ట్రీ అనేది ప్రత్యామ్నాయ దూరం యొక్క ప్రతిబింబం అని మేము విస్తృతమైన కంప్యూటర్ అనుకరణ ద్వారా చూపుతాము. మ్యాక్స్-మినీ బ్రాంచ్ & బౌండ్ మెథడ్ మరియు మినిమిని హ్యూరిస్టిక్ మోడల్ ప్రభావం మరియు క్యారెక్టర్ బేస్డ్ ట్రీతో అనుబంధించబడిన లాగ్ సంభావ్యత కూడా చర్చించబడ్డాయి. మేము ప్రోటీన్ల సంబంధాన్ని సంపూర్ణంగా విశ్లేషించడానికి ML మరియు MPని వర్తింపజేసాము. ఫైలోజెనెటిక్ ట్రీని పునర్నిర్మించడంలో ప్రత్యామ్నాయ నమూనాలు, ఆకార పరామితి, శోధన స్థాయి మరియు SBL కీలక పాత్రను కలిగి ఉన్నాయని మేము నిర్ధారించాము. మాలిక్యులర్ క్లాక్ అధ్యయనం సుదూర సంబంధిత ప్రొటీన్‌లను పోల్చినప్పుడు χ2 విలువ ఎక్కువగా ఉందని చూపిస్తుంది.