కోమో కోఫీ డోనాటియన్ బెనీ, అడ్జేహి డాడీ, డేవిడ్ కౌలిబాలీ ఎన్'గోలో, నథాలీ గెస్సెండ్, సోలాంజ్ ఎకెఎ, కోఫీ మార్సెలిన్ డిజెఇ మరియు మిరెయిల్ డోసో
P. ఎరుగినోసా ఆహార విషప్రయోగంలో పాల్గొనవచ్చు. ఇది రోగనిరోధక శక్తి లేని వ్యక్తులకు అత్యంత వ్యాధికారకమైనది లేదా బలహీనంగా ఉంటుంది, దీని వలన అధిక అనారోగ్యం మరియు మరణాలు సంభవిస్తాయి. ఈ అధ్యయనం యొక్క లక్ష్యం సూడోమోనాస్ ఎరుగినోసా యొక్క పరమాణు గుర్తింపుకు అనువైన ఫైలోజెనెటిక్ మార్కర్‌ను నిర్ణయించడం. న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాల స్వచ్ఛత మరియు గాఢత స్పెక్ట్రోఫోటోమెట్రీ ద్వారా నిర్ణయించబడతాయి. ఫైలోజెనెటిక్ మార్కర్‌లను (16S RNAr, recA, rpoB, STS1) ఉపయోగించి సున్నితత్వ ప్రతిచర్యలు మరియు 42 జాతుల థ్రెషోల్డ్ గుర్తింపును పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్ (PCR) ద్వారా అంచనా వేశారు. 2.1 యొక్క 230 nm వద్ద సగటు శోషణతో, DNA ఎక్స్‌ట్రాక్ట్‌లు 1.7 యొక్క సగటు నిష్పత్తిని (A260/A280) కలిగి ఉంటాయి. సూడోమోనాస్ ఎరుగినోసా రిఫరెన్స్ స్ట్రెయిన్ ATCC 27853 యొక్క థ్రెషోల్డ్ డిటెక్షన్ rpoBకి 0.8 μg/ml మరియు 16S మార్కర్స్ RNAr మరియు recAకి 7.6 μg/ml. సానుకూల నియంత్రణ జాతులు CP2: 1125A మరియు CP3: API యొక్క థ్రెషోల్డ్ డిటెక్షన్ వరుసగా 1.2 μg/ml మరియు 0.1 μg/ml rpoB జన్యువును ఉపయోగించడం కోసం. ఈ థ్రెషోల్డ్ recA జన్యువుకు వరుసగా 12.3 μg/ml మరియు 0.9 μg/ml. rpoB హౌస్ కీపింగ్ జన్యువు యొక్క సున్నితత్వం 97.4%, తరువాత recA మరియు 16S RNAr వరుసగా 87.2% మరియు 82.1%. rpoB జన్యువుల ఫైలోజెనెటిక్ రిజల్యూషన్ 16S rRNA మరియు recA జన్యువుల కంటే ఎక్కువగా ఉంది. ITS1 మార్కర్‌తో ఎటువంటి సున్నితత్వ ప్రతిచర్య గమనించబడలేదు. న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాల నాణ్యత, స్వచ్ఛత మరియు ఫైలోజెనెటిక్ మార్కర్ ఎంపిక PCR విశ్లేషణకు అత్యంత కీలకమైన అంశాలలో ఒకటి.