జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

మైటోకాన్డ్రియల్ మరియు సైటోప్లాస్మిక్ పైరోఫాస్ఫేటేస్ (PPA) జన్యువులు మరియు ప్రోటీన్ల తులనాత్మక మరియు పరిణామ అధ్యయనాలు

రోజర్ ఎస్ హోమ్స్, కింబర్లీ డి స్ప్రాడ్లింగ్-రీవ్స్ మరియు లారా ఎ కాక్స్

అకర్బన పైరోఫాస్ఫేటేస్ (PPA; PPase) (EC: 3.6.1.1) అనేది డైఫాస్ఫేటేస్ ఎంజైమ్ కుటుంబానికి చెందినది, ఇది సకశేరుక కణజాలంలోని సైటోప్లాజం (PPA1) మరియు మైటోకాండ్రియా (PPA2) లోపల డైఫాస్ఫేట్ హైడ్రోలేస్‌గా పనిచేస్తుంది. PPA1 మరియు PPA2 అమైనో ఆమ్ల శ్రేణులు మరియు నిర్మాణాలు మరియు PPA-వంటి జన్యు స్థానాలు అనేక జన్యు ప్రాజెక్టుల నుండి బయోఇన్ఫర్మేటిక్ డేటాను ఉపయోగించి పరిశీలించబడ్డాయి. సీక్వెన్స్ అమరికలు మరియు కీ సంరక్షించబడిన అమైనో ఆమ్ల అవశేషాలు కూడా అధ్యయనం చేయబడ్డాయి (మానవ PPA2 అవశేషాలు గుర్తించబడ్డాయి): మైటోకాన్డ్రియల్ సిగ్నల్ పెప్టైడ్ (1-31); మరియు Mg2+ బైండింగ్ (164Asp, 169Asp మరియు 201Asp), సబ్‌స్ట్రేట్ బైండింగ్ (127Arg) మరియు ప్రోటాన్ డోనర్ సైట్ (138Tyr)కి బాధ్యత వహించే క్రియాశీల సైట్ అవశేషాలు. నివేదించబడిన ఈస్ట్ PPA1 నిర్మాణాన్ని (PDB: 1E9G) ఉపయోగించి సకశేరుక PPA1 మరియు PPA2 కోసం ఊహించిన 2D మరియు 3D నిర్మాణాలు గుర్తించబడ్డాయి. సకశేరుక PPA1 మరియు PPA2 జన్యువులు సాధారణంగా వరుసగా 11 లేదా 12 కోడింగ్ ఎక్సోన్‌లను కలిగి ఉంటాయి, విస్తరింపబడిన ఎక్సాన్ 1 మరియు అదనపు ఎక్సాన్ 3 సకశేరుక PPA2 జన్యువుల కోసం గమనించబడతాయి. మానవ PPA2 జన్యు ప్రమోటర్‌లో ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ ఫ్యాక్టర్ బైండింగ్ సైట్‌లు మరియు CpG104 గుర్తించబడ్డాయి; మరియు PPA2 3'UTR కోసం MiR-590. ఫైలోజెనెటిక్ విశ్లేషణలు ఒక పూర్వీకుల అకశేరుక PPA జన్యువు జన్యు డూప్లికేషన్ ఈవెంట్‌కు గురైందని సూచించింది, ఇది సకశేరుక జన్యు పరిణామం యొక్క 2 వేర్వేరు పంక్తులను రూపొందించింది: PPA1 మరియు PPA2.