జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

టామాటో యొక్క బాక్టీరియా విల్ట్‌కు కారణమయ్యే రాల్‌స్టోనియా సోలనాసియరం బయోవర్స్ 3 మరియు 4 యొక్క భారతీయ జాతుల జీవసంబంధమైన లక్షణం మరియు జన్యు వైవిధ్యం

దినేష్ సింగ్, శ్వేతా సిన్హా, గరిమా చౌదరి మరియు యాదవ్ DK

రాల్‌స్టోనియా సోలనాసియరం బయోవర్స్ 3 మరియు 4 టొమాటో (సోలనమ్ లైకోపెర్సికమ్ ఎల్.) బాక్టీరియా విల్ట్‌కు కారణమవుతుంది, ఇది ప్రపంచవ్యాప్తంగా నేలలో వ్యాపించే మొక్కల వ్యాధికారక వినాశకరమైనది. భారతదేశంలోని జమ్మూ మరియు కాశ్మీర్, హిమాచల్ ప్రదేశ్, ఉత్తరాఖండ్, జార్ఖండ్, ఒరిస్సా రాష్ట్రాల నుండి విల్టెడ్ టొమాటో మొక్కల నుండి R. సోలనేసిరమ్ యొక్క ఎనభై ఏడు ఐసోలేట్లు వేరుచేయబడ్డాయి మరియు వాటిని సాంప్రదాయ మరియు పరమాణు పద్ధతుల ద్వారా వర్గీకరించబడ్డాయి. కార్బన్ మూలాల సమితిని ఉపయోగించి R. సోలనేసిరమ్ యొక్క బయోవర్‌ని నిర్ణయించారు మరియు భారతదేశంలోని అన్ని రాష్ట్రాల్లో R. సోలనేసిరమ్ యొక్క బయోవర్ 3 అత్యంత ప్రముఖంగా (90.2 శాతం) కనుగొనబడింది, అయితే బయోవర్ 4 జార్ఖండ్ మరియు హిమాచల్ ప్రదేశ్ రాష్ట్రాల్లో కనుగొనబడింది. . ఫైలోటైప్ నిర్దిష్ట మల్టీప్లెక్స్ PCR మొత్తం 87కి ఫైలోటైప్ I కింద టొమాటోకు సోకుతున్న R. సోలనేసియరం యొక్క ఐసోలేట్‌లను కేటాయించింది. జన్యు వైవిధ్యాన్ని అధ్యయనం చేయడానికి, BOX-PCR మరియు మల్టీలోకస్ సీక్వెన్స్ టైపింగ్ విధానాలు ఉపయోగించబడ్డాయి. యాంప్లిఫికేషన్ ఉత్పత్తులు BOX-PCR వేలిముద్ర నమూనాలో 500 bp -4 kb వరకు అందించబడ్డాయి మరియు 50% సారూప్యత గుణకం వద్ద R. సోలనేసిరమ్ యొక్క 87 ఐసోలేట్‌ల 23 DNA టైపింగ్ సమూహాలను కనుగొన్నాయి. మల్టీలోకస్ సీక్వెన్స్ టైపింగ్ కింద, hrp (రెగ్యులేటరీ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ రెగ్యులేషన్) మరియు egl (ఎండోగ్లూకనేస్ ప్రికర్సర్) అనే మూడు వైరలెన్స్ జన్యువులు మరియు వివిధ వ్యవసాయ-వాతావరణ మండలాలకు చెందిన R. సోలనాసియరం యొక్క 18 జాతులకు చెందిన fli C జన్యువులు చేయబడ్డాయి. Egl జన్యువు యొక్క శ్రేణి విశ్లేషణ ఆధారంగా, ORT-8, UTT-23 మరియు JHT2 మినహా R. సోలనేసిరమ్ యొక్క భారతీయ జాతులు చాలావరకు ఒకదానికొకటి చాలా దగ్గరగా ఉన్నాయి మరియు GMI1000 జాతికి చాలా దగ్గరగా ఉన్నాయి. ఒంటరిగా ఉన్న ప్రదేశం మరియు వాతావరణ పరిస్థితులతో సంబంధం లేకుండా R. సోలనాసియరం యొక్క భారతీయ ఐసోలేట్‌లలో చాలా జన్యు వైవిధ్యం కనుగొనబడింది.