బయోకెమిస్ట్రీ & అనలిటికల్ బయోకెమిస్ట్రీ

నైరూప్య

సమర్ధవంతంగా మడతపెట్టే ప్యూర్లీ-సిమెట్రిక్ డి నోవో డిజైన్డ్ ప్రొటీన్

మైఖేల్ బ్లేబర్

అనేక గ్లోబులర్ ప్రోటీన్ ఫోల్డ్‌లు కొన్ని రకాల భ్రమణ సమరూపతను ప్రదర్శిస్తాయి - అత్యంత సాధారణ ఉదాహరణ TIM బారెల్ (పునరావృతమయ్యే బీటా-స్ట్రాండ్/టర్న్/ఆల్ఫా-హెలిక్స్/టర్న్ మోటిఫ్ యొక్క 8 రెట్లు భ్రమణ సమరూపతను కలిగి ఉంటుంది). ప్రోటీన్లలో ఈ రకమైన సాధారణ సమరూపత X-రే నిర్మాణ అధ్యయనాల ప్రారంభ రోజుల నుండి స్పష్టంగా కనిపించింది, ఇది జన్యు నకిలీ మరియు కలయిక అంతర్లీన పరిణామ విధానం అనే పరికల్పనకు దారితీసింది. అయితే, 3°- నిర్మాణ స్థాయిలో ఇటువంటి సమరూపత స్పష్టంగా కనిపిస్తున్నప్పటికీ, పునరావృతమయ్యే నిర్మాణాత్మక మూలాంశాలను పోల్చినప్పుడు ఏదైనా 1°-నిర్మాణ సమరూపత తరచుగా ఎక్కువగా ఉండదు. అటువంటి క్రమ విశ్లేషణలు, ఖచ్చితమైన పునరావృత మూలాంశాల కోసం మడత నిరాశకు సంబంధించిన సైద్ధాంతిక పరిశీలనలు, అలాగే పెప్టైడ్‌ల కోసం స్థానికంగా నిర్మాణాత్మకమైన లక్షణాలు తగ్గిన శ్రేణి సంక్లిష్టత (ఖచ్చితమైన పునరావృత మూలాంశాలతో సంభవిస్తాయి) ఫలితంగా ఖచ్చితమైన సమరూపతతో రూపొందించబడిన ప్రోటీన్‌లు అసంభవం అనే ఉదాహరణకి దారితీసింది. సమర్ధవంతంగా మడవటం. ఖచ్చితమైన సమరూపత ప్రోటీన్ డిజైన్‌లో అంతర్లీనంగా ఉన్న కాంబినేటోరియల్ పేలుడు సమస్యను గణనీయంగా తగ్గిస్తుంది, అటువంటి సమస్యలను అసాధ్యమైన నుండి గణనపరంగా ట్రాక్టబుల్‌గా మారుస్తుంది, పూర్తిగా సిమెట్రిక్ డి నోవో రూపొందించిన ప్రోటీన్‌ల కోసం సమర్థవంతమైన మడత యొక్క ప్రదర్శన గణనీయమైన ఆసక్తిని కలిగి ఉంది.